Trước tiên, 32 CLB được phân thành bốn nhóm: căn cứ vào hệ số của từng đội, cụ thể:
Nhóm A (hạt giống hàng đầu): Real Madrid (Tây Ban Nha - hệ số 131,326), Milan (Italy - 121,191), Barcelona (Tây Ban Nha - 117,326), Liverpool (Anh - 115,864), M.U (Anh - 110,864), Inter (Italy - 101,191), Bayern Munich (Đức - 97,166), Arsenal (Anh - 93,864)
Nhóm B: Porto (Bồ Đào Nha - 93,739), Juventus (Italy - 93,191), PSV (Hà Lan - 84,145), Lyon (Pháp - 81,324), Panathinaikos (Hy Lạp - 70,715), Chelsea (Anh - 68,864), Viilarreal (Tây Ban Nha - 58,326), Ajax (Hà Lan - 52,145).
Nhóm C: Club Bruges (Bỉ - 50,476), Anderlecht (Bỉ - 47,476), Olympiakos (Hy Lạp - 46,715), Schalke 04 (Đức - 44,166), Sparta Prague (Czech - 43,223), Lille (Pháp - 41,324), Rangers (Scotland - 40,476), Bremen (Đức - 40,1 66).
Nhóm D: Benffica (Bồ Đào Nha - 36,739), Rosenborg (Na Uy - 36,665), Betis (Tây Ban Nha - 34,326), Udinese (Italy - 30,1 91 ), Fenerbahce (TNK - 23,872), Rapid Vienna (Áo - 15,208), Thun (Thụy Sĩ - 6,887), Artmedia Bratisiava (Slovakia - 4,850).
Trên nguyên tắc, không đội nào được gặp đội bóng cùng chung Liên đoàn, trừ ĐKVĐ Liverpool. Do được UEFA đặc cách cho tham dự vòng loại Champions League, Liverpool mất quyền "miễn trừ" này.
Như UEFA phân chia, Liverpool cùng Arsenal và M.U nằm ở nhóm A, còn Chelsea ở nhóm B. Do thuộc nhóm B, Chelsea gặp nhiều khó khăn: chắc chắn không gặp M.U, Arsenal, nhưng nhiều khả năng phải gặp Liverpool, Real Madrid, AC Milan hoặc Barcelona. Trong khi đó, Thun, Rapid Vienna và Artmedia Bratislava được xem là đối thủ "lý tưởng" của nhiều đội mạnh.
Kết thúc lễ rút thăm, quả là duyên số khi Liverpool và Chelsea rơi vào cùng bảng. Bayern Munich chung bảng với Juventus, Milan vơi PSV cũng là những cặp từng nặng nợ với nhau. Tuy nhiên, căng nhất là bảng của M.U, với các đối thủ khá cân sức. Kết quả bốc thăm cụ thể như sau:
- Bảng A: Bayern Munich, Juventus, Club Brugge, Rapid Vienna.
- Bảng B: Arsenal, Ajax, Sparta Prague, Thun.
- Bảng C: Barcelona, Panathinaikos, Bremen, Udinese.
- Bảng D: M.U, Villarreal, Lille, Benfica.
- Bảng E: AC Milan, PSV Eindhoven, Schalke, Fenerbahce.
- Bảng F: Real Madrid, Lyon, Olympiakos, Rosenborg.
- Bảng G: Liverpool, Chelsea, Anderlecht, Betis.
- Bảng H: Inter Milan, Porto, Rangers, Artmedia Bratislava.
