Theo quyết định, Phó Thủ tướng Nguyễn Văn Thắng làm Chủ tịch Hội đồng điều hành Trung tâm tài chính quốc tế tại Việt Nam. Phó Chủ tịch Thường trực Hội đồng là Thứ trưởng Tài chính Nguyễn Thị Bích Ngọc. Các Phó Chủ tịch Hội đồng gồm: Thống đốc Ngân hàng Nhà nước Việt Nam Phạm Đức Ấn; Chủ tịch Ủy ban nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh Nguyễn Văn Được; Chủ tịch Ủy ban nhân dân thành phố Đà Nẵng Nguyễn Mạnh Hùng.
Hội đồng điều hành có chức năng, nhiệm vụ chỉ đạo, điều phối thống nhất việc xây dựng, vận hành và phát triển Trung tâm tài chính quốc tế tại Việt Nam và thực hiện các nhiệm vụ, quyền hạn theo quy định tại khoản 2 Điều 9 Nghị định số 323/2025/NĐ-CP của Chính phủ về thành lập Trung tâm tài chính quốc tế.
Hội đồng chỉ đạo việc định hướng và xây dựng thể chế, chính sách áp dụng tại Trung tâm tài chính quốc tế thống nhất, tập trung, xuyên suốt; bảo đảm tính độc lập, chuyên nghiệp, minh bạch, an toàn, hiệu quả và phù hợp với thông lệ quốc tế trong xây dựng, vận hành và phát triển Trung tâm tài chính quốc tế. Ban hành chiến lược, lộ trình, kế hoạch phát triển Trung tâm tài chính quốc tế trên cơ sở điều kiện, tiềm năng và nhu cầu phát triển tại Thành phố Hồ Chí Minh và thành phố Đà Nẵng.
Bên cạnh đó, Hội đồng điều hành còn có nhiệm vụ chỉ đạo, điều phối công tác phối hợp giữa các bộ, ngành, địa phương và cơ quan liên quan trong tổ chức, hoạt động; bố trí, huy động nguồn lực; hợp tác quốc tế về phát triển Trung tâm tài chính quốc tế; cho ý kiến đối với việc bổ nhiệm, miễn nhiệm, bãi miễn Chủ tịch Cơ quan điều hành tại hai thành phố.
Bộ Tài chính là cơ quan thường trực, tham mưu, giúp việc cho Hội đồng điều hành; phối hợp các cơ quan liên quan theo dõi tình hình hoạt động của Trung tâm tài chính quốc tế; chủ động thiết kế, kiến nghị cơ chế chính sách để phát triển sản phẩm mới, nâng cao hiệu quả hoạt động của Trung tâm tài chính quốc tế.