Nội tự của chùa trước đây diện tích rất rộng, phía nam giáp với nghĩa trang liệt sĩ Ngọc Hồi, phía tây nam giáp với quốc lộ 1A.Trước đây, vì điều kiện hoàn cảnh đất nước có chiến tranh, vì vậy năm 1966, thành phố có giới thiệu về xã và thôn cho Trạm thương binh bao bì thành phố mượn khu vực nội tự của chùa để sơ tán trong thời kỳ chiến tranh. Khi hết chiến tranh, Trạm thương binh bao bì thành phố đã giao toàn bộ phần đất trước đây mượn của nhà chùa cho Xí nghiệp Kim khí Ngũ Hiệp quản lý. Thời gian gần đây, Xí nghiệp Kim khí Ngũ Hiệp chuyển nhượng cho Công ty cổ phần thiết bị kỹ thuật điện Hàm Long. Toàn bộ phần đất mà Công ty cổ phần thiết bị kỹ thuật điện Hàm Long đang sử dụng trước đây là đường vào và là cổng tam quan của chùa Linh Sơn. Sau một thời gian dài không có sư, thì đến năm 1989, chùa Linh Sơn có sư về trụ trì để chăm lo đời sống tâm linh của người dân, vì vậy, nhà chùa gặp rất nhiều khó khăn vì đất quá chật hẹp. Chùa không có sân, không có khu vệ sinh; đường đi vào chùa phải đi nhờ qua đình và đền Lưu Phái. Nay nhiều Phật tử và nhân dân thôn Lưu Phái đề nghị các cấp chính quyền giải quyết cho nhà chùa lấy lại toàn bộ diện tích đất trước đây đã cho mượn để nhà chùa quy hoạch, cải tạo, nâng cấp chùa Linh Sơn ngày càng khang trang, đẹp đẽ hơn.
Về nội dung khiếu nại nêu trên, Báo Nhân Dân nhận được Công văn trả lời số 513, ngày 27-2-2014, của Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch Hà Nội, nội dung chính như sau: Di tích chùa Lưu Phái (Linh Sơn tự), thôn Lưu Phái, xã Ngũ Hiệp đã xếp hạng cấp thành phố tại Quyết định số 601 ngày 26-1-2006, của UBND thành phố Hà Nội, hiện do UBND huyện Thanh Trì quản lý theo phân cấp của thành phố. Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch Hà Nội đề nghị UBND huyện Thanh Trì chỉ đạo các phòng, ban chức năng của huyện kiểm tra, xem xét giải quyết theo thẩm quyền, báo cáo UBND TP Hà Nội và trả lời Báo Nhân Dân bằng văn bản.
Đơn của ông Trần Công Hạnh, ở số 134/9A, tổ 42A, khu phố 2, phường Tân Chánh Hiệp (quận 12) khiếu nại việc cưỡng chế giải tỏa công trình xây dựng. Theo ông Hạnh, việc UBND quận 12 và UBND phường Tân Chánh Hiệp ra quyết định và thực hiện việc cưỡng chế đối với gia đình ông là không đúng quy định của pháp luật. Báo Nhân Dân nhận được Công văn trả lời số 43, ngày 25-1-2014, của Viện Kiểm sát Nhân dân TP Hồ Chí Minh. Nội dung chính công văn như sau: Viện Kiểm sát Nhân dân TP Hồ Chí Minh hướng dẫn ông Trần Công Hạnh gửi đơn đến UBND thành phố Hồ Chí Minh để giải quyết theo thẩm quyền.
