Các sai sót chủ yếu là áp sai danh mục kỹ thuật, sai mã đối tượng tham gia BHYT. Các bệnh viện phải rà soát, giải trình, nếu không sẽ bị BHXH TP Hà Nội xuất toán.
Hiện nay, các cơ sở y tế trên địa bàn phải thực hiện gửi dữ liệu khám chữa bệnh cho cơ quan bảo hiểm xã hội ngay sau khi người bệnh ra viện, nhằm giám định và phát hiện kịp thời các chỉ định chưa đúng của cơ sở y tế. BHXH TP Hà Nội sẽ phối hợp các cơ sở khám chữa bệnh, tăng cường kiểm soát chi phí khám chữa bệnh bảo hiểm y tế để phòng, chống trục lợi quỹ bảo hiểm y tế.
Đến tháng 5-2017, TP Hà Nội có 5.889.565 người tham gia bảo hiểm y tế, đạt tỷ lệ 82,4% số dân TP Hà Nội.