23 CTTT này đang được thực hiện tại 17 trường đại học. Khó khăn cũng là hạn chế lớn nhất trong quá trình triển khai thí điểm đào tạo CTTT là trình độ tiếng Anh của giảng viên các môn cơ bản và của sinh viên còn yếu, thời gian giảng dạy của giảng viên nước ngoài ngắn; kinh phí và cơ chế tài chính cho chương trình chưa phù hợp. Bộ GD-ÐT đang cùng Bộ Tài chính và các bộ, ngành liên quan chuẩn bị ban hành Thông tư hướng dẫn chế độ tài chính trong thực hiện CTTT và năm 2009 tiếp tục mở rộng chương trình với việc xét chọn thêm khoảng mười chương trình để tuyển sinh vào năm học 2010 - 2011.