Đây là kỳ thi được các học sinh có học lực khá giỏi trong toàn thành phố Hải Phòng quan tâm.
Để đỗ vào trường này, các thí sinh phải đủ điểm đỗ vào trường THPT công lập theo đăng ký trong kỳ thi vào lớp 10 (đại trà) được tổ chức vào ngày 22-6 trước đó. Đồng thời phải đủ điểm khi dự thi các môn tiếng Anh (điều kiện) và một hoặc hai trong các môn chuyên. Điểm chuẩn được tính từ cao xuống thấp.
Trong đó, lớp chuyên Toán có số học sinh đăng ký dự thi là 768 thí sinh. Đây cũng là lớp có tỷ lệ chọi cao nhất là 1/21,9;
Lớp chuyên Văn có 730 thí sinh dự thi. Tỷ lệ chọi là 1/20,8;
Lớp chuyên Vật lý có 197 thí sinh dự thi. Tỷ lệ chọi là 1/5,6;
Lớp chuyên Hóa học có 217 thí sinh dự thi. Tỷ lệ chọi là 1/6,2;
Lớp chuyên Sinh học có 195 thí sinh dự thi. Tỷ lệ chọi là 1/5,5;
Lớp chuyên tiếng Anh có 904 thí sinh dự thi (hai lớp). Tỷ lệ chọi là 1/ 12,9.
So với năm học trước, số thí sinh dự thi vào các lớp chuyên năm học này giảm gần 900 thí sinh do quy định mới yêu cầu các thí sinh phải thi thêm môn tiếng Anh điều kiện.
Trong đó, lớp chuyên Toán giảm 447 thí sinh, lớp chuyên Văn giảm 327 thí sinh, lớp chuyên tiếng Anh giảm 123 thí sinh...
Kỳ thi được tổ chức trong hai ngày, 25 và 26-6. Ngày 25-6, buổi sáng các thí sinh làm bài thi môn tiếng Anh (điều kiện), chiều làm bài thi môn Toán chuyên và Ngữ văn chuyên. Ngày 26-6, các thí sinh làm bài thi môn Hóa học chuyên, tiếng Anh chuyên, Vật lý chuyên và Sinh học chuyên.
Năm học 2012-2013, Trường THPT chuyên Trần Phú tuyển sinh 15 lớp với 555 học sinh, gồm 11 lớp chuyên, ba lớp không chuyên và một lớp song ngữ.
Riêng lớp song ngữ không tổ chức thi tuyển sinh mà tuyển thẳng số học sinh lớp song ngữ Trường THCS Hồng Bàng đã tốt nghiệp THCS.
So với năm học trước, năm học này trường tuyển sinh tăng thêm một lớp chuyên tiếng Anh.
