Trước đó, qua công tác kiểm tra thuế tại Công ty Hùng Thịnh, Chi cục thuế thành phố Long Xuyên phát hiện Công ty Hùng Thịnh sử dụng 9 hóa đơn bất hợp pháp do công ty của Lê Văn Trường (làm giám đốc) cấp.
Qua xác minh, Chi cục thuế thành phố Long Xuyên xác định 9 hóa đơn trên có giá trị đến 12,5 tỷ đồng. Trong đó, số tiền trốn thuế và gian lận tiền thuế GTGT, thu nhập doanh nghiệp trên 3,7 tỷ đồng. Ngành chức năng đã tổng hợp hồ sơ gửi đến Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an thành phố Long Xuyên kiến nghị điều tra, xác minh làm rõ. Sau khi tiếp nhận, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an thành phố Long Xuyên đã tiến hành các biện pháp điều tra, xác minh.
Ngày 26/4/2023, Lê Văn Trường đã đến Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an thành phố Long Xuyên đầu thú. Đối tượng khai nhận: Đầu năm 2018, Trường được một người đàn ông tên Hùng (không rõ họ, địa chỉ) yêu cầu Trường đứng tên làm Giám đốc cho Công ty Hoàng Phát với số tiền công 12 triệu đồng/tháng. Khi Trường đồng ý, Hùng giới thiệu cho Trường quen biết Nguyễn Thành Luân, Giám đốc Công ty Hùng Thịnh.
Theo yêu cầu của Hùng, Trường đã ký tên xuất khống 27 hóa đơn GTGT của Công ty Hoàng Phát cho Công ty Hùng Thịnh đã có ghi nội dung nhưng thực tế không có diễn ra mua bán hàng hóa, dịch vụ thể hiện trên hóa đơn.