Theo Ban chỉ huy phòng, chống thiên tai và tìm kiếm cứu nạn Bắc Ninh, hiện nay trên địa bàn có 241 km đê, 162 cống và 41 kè hộ bờ và chống sóng. Những năm qua, hệ thống đê điều trên địa bàn tỉnh đã được tu bổ, hoàn thiện về cao trình, mặt cắt, gia cố hoàn chỉnh và kéo dài các kè xung yếu, làm mới bổ sung, xây lại các cống dưới đê nhằm bảo đảm an toàn các tuyến đê trong mùa mưa bão. Tuy nhiên, do hệ thống đê trên địa bàn đi qua nhiều vùng, khu vực có nền địa chất mềm yếu; đất đắp đê có hàm lượng pha cát lớn, không đồng nhất nên còn nhiều tiềm ẩn khó lường gây uy hiếp đến an toàn của đê, nhất là khi có lũ cao và gặp tổ hợp gió bão lớn. Trong đó, một số khu vực nền đê mềm yếu thường xuất hiện sủi, đùn khi mực nước sông cao như khu vực Đình Tổ, Đại Đồng Thành huyện Thuận Thành; Đại Lai, Cao Đức huyện Gia Bình; Cáp Điền, Cáp Thủy, Lai Hạ huyện Lương Tài. Ngoài ra, ở một số khu vực do đất đắp không đồng nhất có hàm lượng cát pha lớn, đắp qua nhiều thời kỳ nên tại những vị trí có mặt cắt lòng sông rộng, khi lũ lên cao xuất hiện sạt lở trên diện rộng ở một số địa phương của huyện Thuận Thành, Tiên Du, Gia Bình… Hơn nữa, một số kè sát đê tại các khu vực sông cong có diễn biến lòng dẫn phức tạp thường xuất hiện sự cố sạt lở trong mùa lũ uy hiếp đến an toàn của đê như khu vực kè Thị Thôn - Mão, Đức Tài (đê tả Đuống); kè Yên Hậu, Cầu Hồng (đê hữu Cà Lồ); kè Việt Thống, Yên Ngô (đê hữu Cầu). Mặt khác, do tình trạng xuống cấp của các trạm bơm tiêu nên khả năng tiêu nước của các trạm bơm bị hạn chế. Dẫn đến hệ quả là khi có mưa lớn, một số vùng cục bộ thường xuyên bị ngập úng.
Phó Chi cục trưởng Đê điều và Phòng chống lụt bão Bắc Ninh Nguyễn Hữu Dũng cho biết, trước mùa mưa bão năm 2016, cùng với việc xác định những khu vực tiềm ẩn nguy cơ mất an toàn để có phương án xử lý, tỉnh cũng đang tích cực triển khai tu bổ, bảo dưỡng các tuyến đê. Chỉ huy trưởng công trình kè Hữu Ái xã Giang Sơn (Công ty xây dựng Ninh Giang) Nguyễn Văn Xếp cho biết: “Chúng tôi đang huy động các phương tiện, máy móc và nhân lực để thi công công trình nhằm bảo đảm đúng tiến độ đề ra. Theo dự kiến, công trình sẽ thi công xong trước tháng 7 để bàn giao cho chủ đầu tư cũng như bảo đảm an toàn đê trong mùa mưa bão”.
Nhằm hạn chế thấp nhất những thiệt hại do thiên tai gây ra trong mùa mưa bão năm 2016, UBND tỉnh Bắc Ninh cũng yêu cầu các sở, ban, ngành liên quan và các địa phương tuyên truyền nâng cao nhận thức của người dân trong việc thực hiện Luật Phòng, chống thiên tai, Luật Đê điều, Pháp lệnh bảo vệ và khai thác công trình thủy lợi. Khi lũ trên sông ở mức trên báo động III, các cấp, ngành tổ chức triển khai kế hoạch chủ động đối phó với những tình huống xấu có thể xảy ra. Thường xuyên kiểm tra, nắm chắc hiện trạng công trình đê điều và hệ thống công trình chống úng nội đồng; xác định các khu vực trọng điểm xung yếu, xây dựng phương án có thể xảy ra để chuẩn bị các điều kiện về nhân lực, vật lực phục vụ công tác phòng, chống, hạn chế thấp nhất những thiệt hại do thiên tai gây ra; chủ động xây dựng phương án đối phó sát với tình hình thực tế của địa phương; chú trọng công tác bốn tại chỗ (chỉ huy tại chỗ, lực lượng tại chỗ, hậu cần tại chỗ và phương tiện tại chỗ), nhất là các vị trí trọng điểm, các vị trí xa nơi dân cư, điều kiện ứng cứu khó khăn. Ngoài những khu vực trọng điểm mất an toàn, các huyện, thị xã, thành phố tiếp tục rà soát điểm xung yếu khác. Từ đó, chủ động các phương án phòng, chống khi có sự cố xảy ra.