Hai bị can bị truy tố về tội điều động hoặc giao cho người không đủ điều kiện điều khiển các phương tiện giao thông đường thủy; vi phạm quy định về điều khiển phương tiện giao thông đường thủy và đưa vào sử dụng các phương tiện giao thông đường thủy không bảo đảm an toàn.
Theo cáo trạng, khoảng 11 giờ 30 phút ngày 20-3-2016, Giang điều khiển tàu kéo SG-3745 đẩy sà lan SG-5984 chở khoảng 800 tấn cát. Khi đến khu vực cầu Ghềnh thì gặp dòng nước xoáy, do không có bằng lái, thiếu kinh nghiệm điều khiển nên Giang đã để cho sà lan đâm vào trụ cầu số 2 gây sập hai nhịp cầu Ghềnh làm tê liệt tuyến đường sắt Bắc - Nam.
Đối với bị can Thượng, khi sà lan đến khu vực TP Hồ Chí Minh vào cùng ngày xảy ra tai nạn (20-3-2016), do bận công việc riêng nên đã lên bờ giao tàu lại cho Giang điều khiển chở cát đến TP Biên Hòa (Đồng Nai) tiêu thụ thì xảy ra sự cố đâm sập cầu Ghềnh.
