Theo đó, Quỹ đầu tư mạo hiểm Thành phố Hồ Chí Minh sẽ hoạt động theo mô hình Công ty cổ phần với tên gọi Công ty cổ phần Quỹ đầu tư mạo hiểm Thành phố Hồ Chí Minh. Mô hình này cho phép tách biệt rõ ràng giữa quyền sở hữu (của Nhà nước và các nhà đầu tư tư nhân) và quyền điều hành (của đội ngũ chuyên gia đầu tư).
Quỹ hoạt động theo nguyên tắc thị trường, minh bạch, không bảo lãnh vốn Nhà nước và không chịu sự can thiệp hành chính vào các quyết định đầu tư cụ thể. Cơ cấu tổ chức minh bạch bao gồm Đại hội đồng cổ đông, Hội đồng quản trị, Ban Kiểm soát, Ban Điều hành và Hội đồng Đầu tư độc lập.
Quỹ được thuê các đơn vị tư vấn/Quản lý đầu tư (Công ty quản lý quỹ hoặc Công ty tư vấn đầu tư) chuyên nghiệp để thực hiện việc quản lý và triển khai hoạt động đầu tư bảo đảm hiệu quả cao nhất.
Quỹ có các mục tiêu dài hạn: Dự kiến đầu tư vào 50 đến 150 doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo, doanh nghiệp khoa học, công nghệ cao trong giai đoạn 2026-2035. Hỗ trợ thương mại hóa ít nhất 50 sản phẩm/công nghệ và ươm tạo tối thiểu 5 doanh nghiệp công nghệ quy mô lớn.
Về huy động vốn, quỹ tạo cơ chế "vốn mồi", thu hút tối thiểu 2-3 đồng vốn tư nhân cho mỗi một đồng vốn Nhà nước, đưa tỷ lệ huy động nguồn lực xã hội chiếm hơn 60% tổng kinh phí quỹ.
Về hiệu quả kinh tế-xã hội, quỹ góp phần nâng tỷ trọng đóng góp của kinh tế đổi mới sáng tạo và công nghệ cao lên 20-25% GRDP của Thành phố Hồ Chí Minh vào năm 2030.
