Tổng Công ty Phát điện số 1, Tổng Công ty Phát điện số 2 và Tổng Công ty Phát điện số 3, hoạt động theo mô hình công ty mẹ - công ty con, trong đó công ty mẹ là công ty TNHH một thành viên do EVN làm chủ sở hữu. Các nhà máy điện đa mục tiêu vẫn do EVN quản lý như hiện nay.
Thủ tướng giao Bộ Công thương quyết định thành lập công ty mẹ - Tổng Công ty Phát điện nói trên theo quy định hiện hành và EVN quyết định mô hình tổ chức quản lý, nhân sự, phê duyệt điều lệ tổ chức, hoạt động và các vấn đề khác của công ty mẹ theo quy định hiện hành sau khi có quyết định thành lập của Bộ Công thương.
