Trên tinh thần giáo dục khai phóng, vấn đề đổi mới trong đào tạo nghệ thuật bắt đầu từ việc đề cao sự sáng tạo và tự do, xóa nhòa ranh giới giữa nghệ thuật phương Đông và phương Tây, hướng đến sự đồng điệu giữa triết lý nghệ thuật vị nghệ thuật và nghệ thuật vị nhân sinh. Đây là những yếu tố cốt lõi của mô hình giáo dục đa ngành, liên ngành, nơi mỗi cá nhân được khuyến khích phát huy mọi khả năng của mình.

Từ việc đóng vai trò nòng cốt, thúc đẩy hệ thống giáo dục sau đại học cho đến quá trình trở thành một trong những đơn vị đầu tiên được Đại học Quốc gia Hà Nội giao nhiệm vụ triển khai các chương trình đào tạo mang tính chất liên lĩnh vực, Khoa Các khoa học liên ngành đã từng bước tạo dựng các giá trị và nền tảng cốt lõi, làm cơ sở vững chắc để hình thành Trường Khoa học liên ngành và Nghệ thuật.