Theo cáo trạng, khoảng tháng 10/2019, Chính quen biết một số người có nhu cầu nhập khẩu hàng hóa từ nước ngoài về Việt Nam để tiêu thụ. Những người này thuê Chính thực hiện các thủ tục Hải quan để nhập khẩu hàng hóa và trả phí dịch vụ.
Đối với hàng hóa được nhập khẩu từ Trung Quốc, chủ hàng là người tên Lâm, người gốc Hoa, sinh sống tại TP Hồ Chí Minh. Đối với hàng hóa nhập khẩu từ các nước khác như châu Âu, Hàn Quốc, Nhật Bản....thì chủ hàng là Dũng và Kiên. Việc liên lạc giữa Chính với những người tên Lâm, Kiên, Dũng được thực hiện qua mạng xã hội Viber, Wechat.
Để thực hiện việc nhập khẩu hàng hóa về Việt Nam qua Cảng Đà Nẵng, Chính liên hệ và yêu cầu Hạnh thành lập và cung cấp thông tin của một số doanh nghiệp tại Đà Nẵng để Chính đưa cho các chủ hàng, mục đích để chủ hàng báo cho bên xuất khẩu hàng hóa điền thông tin các doanh nghiệp này vào vận đơn với tư cách là đơn vị nhập khẩu hàng hóa.
Từ tháng 10/2019 đến tháng 11/2020, Chính gửi bản chụp chứng minh nhân dân của người khác cho Hạnh để Hạnh sử dụng thành lập và đăng ký chữ ký số tổng cộng 9 Công ty tại TP Đà Nẵng, gồm: Công ty TNHH Thiên Phú Thành Phát; Công ty TNHH Thương mại Dịch vụ Sunset; Công ty TNHH Thương mại One Express; Công ty TNHH Dịch vụ Hoàng Thổ; Công ty TNHH Thương mại Red Tide; Công ty TNHH Thương mại Blue Bayou; Công ty TNHH Thương mại New Hill; Công ty TNHH Thương mại Fly Tiger và Công ty TNHH Dịch vụ Blue Island.
Chính mở Văn phòng làm việc tại địa chỉ số 36/33 Nguyễn Gia Trí, phường 25, quận Bình Thạnh, TP Hồ Chí Minh. Tại đây, Chính thuê các nhân viên làm việc gồm Huy, Nhàn và Hứa Mỹ Xuân (sinh năm 1992, trú ấp An Trung, xã Định An, Gò Quao, Kiên Giang). Huy phụ trách việc lập các chứng từ nhập khẩu khống (invoice, packing list) và thực hiện thủ tục khai báo Hải quan nhập khẩu. Nhàn phụ trách việc nhận, chuyển tiền chi phí liên quan đến lô hàng nhập khẩu. Xuân theo dõi hành trình của tàu, đặt tàu vận chuyển nội địa đối với các lô hàng giao tại TP Hồ Chí Minh. Tại Đà Nẵng, Hạnh làm việc tại nơi thường trú đồng thời là trụ sở Công ty TNHH tư vấn Nhật Long tại số nhà 814/79/2 Trần Cao Vân, quận Thanh Khê, TP Đà Nẵng.
Chính trả lương cho Huy 20 triệu đồng/1 tháng, trả cho Nhàn từ 7 triệu đồng đến 10 triệu đồng/1 tháng, trả cho Xuân khoảng 10 triệu đồng/1 tháng. Chính trả công cho Hạnh theo từng container nhập khẩu, mỗi container từ 3 triệu đồng đến 5 triệu đồng.
Qua điều tra xác định từ ngày 27/12/2019 đến 26/11/2020, Chính sử dụng pháp nhân của 6 doanh nghiệp để nhập khẩu tổng cộng 232 lô hàng từ nước ngoài về Việt Nam, trong số này có 210 lô hàng đã được thông quan và tiêu thụ. Có 22 lô hàng bị cơ quan chức năng phát hiện sai phạm nên tiến hành tạm giữ để điều tra. Trong số 22 lô hàng bị tạm giữ, có 18 container chưa làm thủ tục khai báo Hải quan nhập khẩu và 4 container đã được mở tờ khai Hải quan nhập khẩu. Các container này đã được cơ quan chức năng tổ chức khám xét. Tổng giá trị của hàng hóa chứa trong 22 container là 71.326.937.441 đồng.
Về hành vi làm giả tài liệu các cơ quan, tổ chức của Chính: Quá trình Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an Đà Nẵng thi hành Lệnh giữ người trong trường hợp khẩn cấp thì phát hiện và thu giữ 4 chứng minh nhân dân. Số chứng minh nhân dân này do Chính thuê người làm giả.
Hội đồng xét xử Tòa án nhân dân TP Đà Nẵng đã tuyên phạt Ngô Duy Chính 16 năm tù về tội “Buôn lậu" và 2 năm tù về tội "Làm giả tài liệu của cơ quan, tổ chức”, tổng hợp hình phạt Chính phải thi hành là 18 năm tù. Các bị cáo Hạnh, Huy và Nhàn cùng mức án 7 năm tù về tội “Buôn lậu".
