Năm 2021, Ban Quản lý khu kinh tế tỉnh Kon Tum đã chỉ đạo các phòng chuyên môn tăng cường đôn đốc, hướng dẫn các nhà đầu tư đã được cấp quyết định chủ trương đầu tư, giấy chứng nhận đăng ký đầu tư đối với các dự án đầu tư trong khu kinh tế cửa khẩu quốc tế Bờ Y, các khu công nghiệp trên địa bàn tỉnh bị chậm tiến độ thực hiện dự án theo cam kết phải đẩy nhanh tiến độ thực hiện dự án đầu tư, bảo đảm tiến độ theo cam kết; đối với các dự án dừng/tạm dừng hoạt động sớm đưa dự án vào hoạt động trở lại.
Kết quả đã có 6 nhà đầu tư tự nguyện chấm dứt dự án đầu tư, trả lại đất với tổng diện tích đất hơn 11,4 ha. Trong đó khu công nghiệp Hòa Bình có 3 dự án trả lại đất với tổng diện tích đất hơn 3,3 ha và tại khu kinh tế Cửa khẩu quốc tế Bờ Y có 3 dự án với tổng diện tích đất hơn 8 ha.
Bên cạnh đó, Ban Quản lý khu kinh tế tỉnh Kon Tum đã tham mưu đề xuất Ủy ban nhân dân tỉnh Kon Tum tổ chức thanh tra việc quản lý sử dụng đất dự án Nhà máy bột giấy và giấy Tân Mai Kon Tum của Công ty CP Tân Mai. Đến nay đã được Ủy ban nhân dân tỉnh kết luận để tiến hành thu hồi đất, giao cho Ban Quản lý khu kinh tế quản lý sử dụng 100 ha đất tại khu công nghiệp Đăk Tô theo quy định.