Cụ thể, từ ngày 1/2 đến 28/4, đơn vị thi công sẽ rào chắn cố định trên đường Phạm Ngọc Thạch với chiều dài khoảng 240m, bề rộng rào chắn 10m, phần đường dành cho xe chạy còn lại mỗi bên khoảng 5,5m. Bề rộng mặt đường Phạm Ngọc Thạch còn lại 5,5m. Rào chắn cố định trên đường Chùa Bộc chiều dài khoảng 125m, bề rộng rào chắn 10m. Bề rộng mặt đường Chùa Bộc còn lại mỗi bên từ 5,5 đến 7m. Rào chắn nút Chùa Bộc-Phạm Ngọc Thạch nối liền hai đoạn rào chắn hiện trạng trên đường Chùa Bộc và Phạm Ngọc Thạch chiều dài rào chắn bổ sung khoảng 40m, bề rộng 10m.
Về phương án phân luồng tổ chức giao thông, đơn vị chức năng cấm các phương tiện hướng từ phố Phạm Ngọc Thạch đi Tôn Thất Tùng, Đông Tác và các phương tiện rẽ trái từ phố Tôn Thất Tùng đi Chùa Bộc. Các phương tiện đi các hướng còn lại qua nút giao di chuyển bình thường theo sự điều khiển hướng dẫn của hệ thống đèn tín hiệu giao thông, biển báo giao thông.
Tổ chức ô- tô đi một chiều trên tuyến đường Đông Tác theo đoạn và hướng từ Lương Định Của đi Chùa Bộc. Các phương tiện hướng từ phố Phạm Ngọc Thạch đi Đông Tác, Tôn Thất Tùng đi theo hướng: Phạm Ngọc Thạch-Lương Định Của - Đông Tác-Tôn Thất Tùng.
Xe máy, xe đạp từ Tôn Thất Tùng rẽ trái đi Chùa Bộc đi theo hướng phố Tôn Thất Tùng-Đông Tác-Lương Định Của-Phạm Ngọc Thạch - Chùa Bộc hoặc quay đầu tại điểm mở dải phân cách trên đường Phạm Ngọc Thạch đi Chùa Bộc.
Các xe ô tô từ phố Tôn Thất Tùng rẽ trái đi Chùa Bộc đi theo hướng phố Tôn Thất Tùng-Phạm Ngọc Thạch-Đặng Văn Ngữ-Hồ Đắc Di-Tây Sơn-Chùa Bộc hoặc Phạm Ngọc Thạch-Chùa Bộc.
Cấm các xe ô- tô tải có trọng tải toàn bộ xe từ 5 tấn và xe ô tô 16 chỗ trở lên hoạt động trên đường Phạm Ngọc Thạch và Chùa Bộc (trong phạm vi rào chắn công trường).
Đối với phương án phân luồng tổ chức giao thông từ xa, Sở Giao thông vận tải Hà Nội hướng dẫn các phương tiện từ phố Tôn Thất Tùng đi Chùa Bộc hướng từ phố Phạm Ngọc Thạch-Chùa Bộc -Tây Sơn đi theo hướng đường Trường Chinh- Giải Phóng-Xã Đàn-Phạm Ngọc Thạch-Chùa Bộc.
Các phương tiện từ phố Tôn Thất Tùng đi Chùa Bộc theo hướng từ Tây Sơn đi Phạm Ngọc Thạch theo hướng Trường Chinh-Tây Sơn-Chùa Bộc-Phạm Ngọc Thạch. Các phương tiện từ Xã Đàn đi Chùa Bộc theo hướng Nguyễn Lương Bằng-Tây Sơn-Chùa Bộc-Phạm Ngọc Thạch.
Các phương tiện từ Xã Đàn đi Chùa Bộc theo hướng từ Phạm Ngọc Thạch theo hướng: Xã Đàn-Phạm Ngọc Thạch-Chùa Bộc. Các phương tiện trong khu tập thể Trung Tự trên phố Phạm Ngọc Thạch được phân luồng đi theo các hướng Hồ Đắc Di-Nam Đồng-Nguyễn Lương Bằng-Chùa Bộc hoặc hướng Hồ Đắc Di-Xã Đàn-Phạm Ngọc Thạch.
Dự án cầu vượt nút giao Chùa Bộc-Phạm Ngọc Thạch (quận Đống Đa) được triển khai từ tháng 10/2021, dự kiến hoàn thành vào tháng 6/2022, do Ban quản lý dự án Đầu tư xây dựng công trình giao thông thành phố Hà Nội làm chủ đầu tư. Tuy nhiên, do ảnh hưởng của dịch Covid-19 kéo dài, cộng với những vướng mắc trong công tác di chuyển công trình ngầm nổi, do công tác vận chuyển dầm của nhà thầu thi công nên dự án bị chậm tiến độ.