Cuối năm 2006, các cơ quan chức năng và thông tin đại chúng nhận được đơn tố cáo Trần Khải Thanh Thủy, có chữ ký của 94 người dân các địa phương, đề nghị các cơ quan pháp luật khẩn trương có biện pháp ngăn chặn ngay mọi hoạt động chống Nhà nước của Thủy.
Lá đơn có đoạn: "Mục đích chúng tôi ra T.Ư là để khiếu kiện chờ cấp trên chỉ đạo giải quyết đúng pháp luật, nên hằng ngày thường tập trung tại số 1 Mai Xuân Thưởng (trụ sở tiếp dân của T.Ư). Nơi đây, thời gian qua có nhiều phóng viên trong nước và nước ngoài thường nhận đơn thư của dân. Trong số đó, có một phụ nữ tự xưng nhà văn, nhà báo Trần Khải Thanh Thủy, và cho địa chỉ, số điện thoại để bà con sang tận nhà nếu có nhu cầu viết bài khẩn cấp. Chúng tôi tưởng đó là người tốt, muốn giúp bà con. Có ngờ đâu trong thời gian từ tháng 4 cho tới nay, Thủy đã chế biến đơn của bà con thành nhiều bài mang nội dung vu khống bịa đặt, buộc án gán tội, dùng những câu từ bôi nhọ chính quyền. Thủy bán tin cho tổ chức phản động nước ngoài để kiếm tiền cho bản thân và gia đình rồi vu cho chúng tôi tội phản động...".
Trần Khải Thanh Thủy, sinh 1960, đang ở tổ 12, phường Ðức Giang, quận Long Biên (TP Hà Nội). Thủy từng là giáo viên, sau là phóng viên của một tờ báo đoàn thể và cũng đã cộng tác với một số báo, nhưng do thiếu đạo đức nghề nghiệp, vi phạm kỷ luật công tác nên đã bị buộc thôi việc. Vì thế, Thủy bộc lộ tư tưởng bất mãn. Thị đã sưu tầm, lưu giữ và tán phát nhiều tài liệu có nội dung chống Nhà nước do số đối tượng bất mãn, cơ hội chính trị soạn thảo.
Mặc dù cơ quan công an đã nhiều lần răn đe, giáo dục, nhưng với bản chất ngoan cố, lại được sự tiếp tay, cổ vũ của các đối tượng xấu ở trong nước và ngoài nước, từ tháng 10-2005, Trần Khải Thanh Thủy đã sử dụng nhiều bút danh khác nhau (Nguyễn Thái Hoàng, Võ Quế Dương, Phạm Xuân Mai, Nguyễn Thị Hiền, Nguyễn Nại Dương,...) để soạn thảo khoảng 190 bài viết có nội dung xuyên tạc tình hình kinh tế, chính trị, xã hội ở trong nước, vu cáo Việt Nam vi phạm dân chủ, nhân quyền, tán phát trên mạng internet và chuyển ra bên ngoài cho các cá nhân, tổ chức phản động lưu vong sử dụng để chống phá Việt Nam.
Ðể có tư liệu viết bài, Trần Khải Thanh Thủy mạo danh phóng viên báo Phụ nữ để tiếp xúc với những người khiếu kiện nhằm thu thập tình hình, đồng thời chỉ đạo số tay chân là Trần Thị Dung, Hồ Thị Bích Khương, Ðặng Thị Thông, Ðỗ Thị Minh Hằng, Nguyễn Thị Gấm, trực tiếp ghi âm, chụp ảnh, nhận đơn, hồ sơ của những người khiếu kiện từ các tỉnh về Hà Nội gửi cho Thủy để thị chỉnh sửa, biên soạn viết bài đưa lên mạng internet.
Thị còn tải những tài liệu từ trên mạng có nội dung kích động hoạt động chống đối để tán phát cho bà con khiếu kiện, như "Một đề nghị về phương thức thực hiện cuộc tổng nổi dậy" hòng kêu gọi, hướng dẫn cách thực hiện cuộc "tổng nổi dậy" trong ba ngày diễn ra Hội nghị APEC - 2006, bắt đầu bằng các cuộc biểu tình tại các địa phương từ ngày 12 đến 17-11-2006 với danh nghĩa chống tham nhũng, đòi lại đất đai... và đến ngày 17-11-2006 thực hiện mục tiêu "loại bỏ vĩnh viễn chủ nghĩa cộng sản ra khỏi Việt Nam", giải tán Ðảng Cộng sản Việt Nam, đổi tên nước CHXHCN Việt Nam (?).
Ngày 2-9-2006, cơ quan công an đã phát hiện, bắt quả tang Trần Khải Thanh Thủy đang sử dụng dịch vụ internet công cộng để chuyển 15 đầu tài liệu (gồm 1.006 trang) có nội dung tuyên truyền chống Nhà nước, bôi nhọ lãnh tụ Hồ Chí Minh do Thủy biên soạn cho đối tượng ở nước ngoài. Thủy còn tích cực tham gia các diễn đàn chống cộng trên mạng internet (theo sự hướng dẫn của Nguyễn Văn Ðài, đã bị bắt cùng tội danh với Thủy, ngày 6-3-2007), hàng chục lần trả lời phỏng vấn các đài, báo của bọn phản động lưu vong và các thế lực thù địch bên ngoài, bộc lộ quan điểm, tư tưởng chống đối, vu cáo Việt Nam đàn áp những "nhà dân chủ" ở trong nước, kêu gọi tẩy chay cuộc bầu cử Quốc hội khóa XII.
Ðiển hình là ngày 11-3-2007, trong khi cái gọi là "Ðảng Việt Tân" và các tổ chức phản động lưu vong khác đang tổ chức biểu tình trước Ðại sứ quán Việt Nam tại Canada, Trần Khải Thanh Thủy đã điện thoại tới cổ vũ, kêu gọi người Việt ở nước ngoài "đoàn kết" với "phong trào dân chủ" ở trong nước để "lật đổ Ðảng Cộng sản Việt Nam", gợi ý dùng cách bao vây các đại sứ quán Việt Nam ở các nước để biểu tình phản đối, gây áp lực, cao hơn nữa là "ném cà chua, trứng thối" hoặc bắt cóc nhân viên sứ quán, nhân viên ngoại giao Việt Nam để trao đổi với số đối tượng hoạt động chống chính quyền đang bị bắt.
Thủy thừa nhận đã quan hệ, nhận sự chỉ đạo của số đối tượng bất mãn, cơ hội chính trị ở trong nước, có quan hệ chặt chẽ với Nguyễn Văn Ðài, Lê Thị Công Nhân. Thị đã ghi tên tham gia ba tổ chức phản động có danh xưng "Khối 8406" của nhóm Nguyễn Văn Lý, "Công đoàn độc lập" của Nguyễn Khắc Toàn và "Ủy ban nhân quyền Việt Nam" của Nguyễn Văn Ðài.
Nhằm khuyếch trương thanh thế và để có kinh phí hoạt động, Thủy đã thường xuyên liên lạc, móc nối với các cá nhân, tổ chức phản động lưu vong như Nguyễn Gia Kiểng, Nguyễn Thị Hoa tại Pháp; Trần Ngọc Thành, Lê Diễn Ðức ở Ba Lan; Nguyễn Hải, Hoàng Thế Dân ở Mỹ; Nguyễn Hoàng Long ở Canada... để nhận tiền và sự chỉ đạo hoạt động. Theo thống kê chưa đầy đủ, từ cuối năm 2005 đến nay, Trần Khải Thanh Thủy đã nhận được 12.350 USD, 200 EUR và 400 AUD từ các cá nhân, tổ chức phản động lưu vong.
Các tổ chức này đã chỉ đạo Thủy tiếp tục viết bài vu cáo Việt Nam vi phạm dân chủ, nhân quyền; móc nối với công nhân các khu công nghiệp và học sinh, sinh viên để kích động biểu tình; tuyển chọn người đưa sang Thái-lan để huấn luyện sau về nước làm hạt nhân của "phong trào". Ðáng chú ý, đối tượng Nguyễn Hải ở Mỹ đã nhận giới thiệu, bảo lãnh Trần Khải Thanh Thủy tham gia tổ chức phản động "Ðảng Việt Tân", chỉ đạo Thủy xúc tiến thành lập cái gọi là "Hội dân oan" để tham gia liên minh với "Khối 8406" và "Ðảng Thăng tiến" ở trong nước, Hải hứa sẽ vận động các cá nhân, tổ chức ở nước ngoài tài trợ cho Thủy và "hội" này hoạt động.
Vì mục đích khuyếch trương thanh thế và động cơ vụ lợi, Trần Khải Thanh Thủy đã tự ý đưa tên những người khiếu kiện ở các tỉnh vào danh sách tham gia "Hội dân oan" mà không được sự đồng ý của họ, để lấy tiền của tổ chức phản động bên ngoài. Khi những người này phát hiện, đã tỏ thái độ phản đối và viết đơn gửi cơ quan bảo vệ pháp luật tố cáo hành vi vi phạm pháp luật của Trần Khải Thanh Thủy. Ngay cả đối tượng Nguyễn Khắc Toàn cũng cho rằng "Hội dân oan" của Thủy là "hội" ảo được lập ra để trục lợi.
Ngoài ra, Trần Khải Thanh Thủy còn có hành vi kích động người khiếu kiện tổ chức biểu tình, tự thiêu, gây tiếng nổ khi các lực lượng chức năng đến giải thích, yêu cầu bà con khiếu kiện không được tập trung đông người, nằm lỳ tại khu vực Mai Xuân Thưởng; hướng dẫn một số người dùng điện thoại di động trả lời phỏng vấn đài, báo nước ngoài vu cáo chính quyền đàn áp số dân khiếu kiện để các thế lực thù địch sử dụng chống phá ta.
Không những thế, Thủy còn ngang nhiên thách thức chính quyền bắt, xử lý để được "nổi tiếng" và nhận được nhiều tiền tài trợ. Mỗi khi bị cơ quan công an phát hiện, thu giữ tài liệu và đấu tranh vạch mặt, Trần Khải Thanh Thủy đều tìm mọi cách liên lạc, thông báo cho số đối tượng ở bên ngoài biết để tìm sự hậu thuẫn về vật chất, tinh thần và hy vọng sẽ được bên ngoài can thiệp nếu bị công an bắt, xử lý.
Phát hiện các hoạt động vi phạm pháp luật của Trần Khải Thanh Thủy, cơ quan an ninh đã triển khai nhiều biện pháp đấu tranh, từ giáo dục, cảm hóa, đến cảnh cáo răn đe, chính quyền địa phương và nhân dân phường Ðức Giang đã nhiều lần trực tiếp gặp gỡ, giáo dục, khuyên răn, kể cả tổ chức hội nghị nhân dân để phân tích cho Thủy thấy được những hành vi sai trái mà tỉnh ngộ. Nhưng thị đã không tỏ ra hối lỗi mà ngày càng công khai thách thức dư luận, thách đố pháp luật. Hành vi của Trần Khải Thanh Thủy gây phẫn nộ trong đông đảo quần chúng.