Theo đánh giá của đơn vị quản lý, nguyên nhân chủ yếu là do nhiều diện tích rừng đã tồn tại lâu năm, cây tràm bước vào giai đoạn già cỗi dẫn đến chết và đổ ngã. Bên cạnh đó, nguồn nước đỏ hình thành từ đất than bùn làm hạn chế khả năng quang hợp của cây tràm non, ảnh hưởng đến quá trình tái sinh tự nhiên của rừng.