Trên tàu có bảy người gồm: năm thuyền viên và hai cán bộ Đồn Biên phòng cửa khẩu Cảng Phú Quý đang làm nhiệm vụ giám sát đều an toàn.
Ngay sau khi sự cố xảy ra, Đồn Biên phòng Cửa khẩu Cảng Phú Quý đã điều động tàu Hưng Phát neo đậu gần đó tổ chức cứu kéo, nhưng do sóng to gió lớn nên không được. Vào lúc 20 giờ 50 phút, tiếp tục điều động tàu An Hòa 97168 đến hiện trường để bơm hút dầu trên tàu BV 98459 TS nhằm chống chìm và giảm thiệt hại, nhưng cũng không được vì nếu mở nắp hầm dầu nước biển sẽ tràn vào các hầm, nhiều khả năng sẽ chìm toàn bộ tàu và tràn dầu ra ngoài.
Đến sáng 2-7, các phương án để di chuyển các thùng chứa dầu và bơm hút dầu trên tàu bị nạn vẫn chưa triển khai được. Vào khoảng 11 giờ, một số thùng chứa dầu ở trước mũi tàu đã bị vỡ; hầm phía sau ca-bin nước cũng đã tràn vào xuất hiện hiện tượng tràn dầu.
Bộ Chỉ huy Bộ đội Biên phòng (BĐBP) tỉnh đã có báo cáo Ban Chỉ huy Ứng phó sự cố tràn dầu tỉnh cũng như đề nghị Bộ Tham mưu BĐBP báo cáo Ban Chỉ huy ứng phó sự cố tràn dầu quốc gia triển khai các biện pháp ứng phó. Đồng thời đề nghị Trung tâm phối hợp Tìm kiếm cứu nạn khu vực 3 triển khai các biện pháp cứu hộ, cứu nạn tàu cá BV-98459 TS.
Ông Nguyễn Văn Linh, Trưởng phòng Kinh tế - Tài chính huyện Phú Quý, Phó trưởng Ban Chỉ huy Phòng chống thiên tai và Tìm kiếm cứu nạn (PCTT-TKCN) huyện Phú Quý cho biết, huyện đã thành lập một tổ giám sát, theo dõi sự cố do Đồn Biên phòng cửa khẩu cảng Phú Quý phụ trách và một tổ trực ban tại Trạm Biên phòng cảng để theo dõi, báo cáo tình hình.
Hiện tại trong cảng Phú Quý có năm tàu vận tải hành khách-hàng hóa và 10 tàu cá đang neo đậu. Ban Chỉ huy PCTT-TKCN huyện đã chỉ đạo các lực lượng chức năng khi có sự cố tràn dầu xảy ra phải nhanh chóng sơ tán các phương tiện ra khỏi khu vực cảng và không tiếp nhận các loại tàu vào cảng. Đồng thời bố trí lực lượng phòng cháy chữa cháy, đội cứu thương và lực lượng bảo vệ an ninh trật tự tại khu vực cảng để xử lý các tình huống có thể xảy ra.
Trước đó, vào ngày 20-6, lực lượng chức năng Đồn Biên phòng cửa khẩu cảng Phú Quý phát hiện tàu cá BV 98459 TS, trên tàu có năm lao động, chủ tàu là ông Lê Minh Thiện, sinh năm 1973, trú tại xã Tân Bằng, huyện Thới Bình (Cà Mau), đang vận chuyển hơn 70 nghìn lít dầu DO. Qua kiểm tra chủ tàu không xuất trình được hóa đơn chứng từ về số lượng dầu nói trên, nên tàu đã bị tạm giữ để xác minh, điều tra làm rõ.