Đảng bộ Agribank là đảng bộ cấp trên cơ sở trực thuộc Đảng bộ Khối doanh nghiệp Trung ương, là tổ chức đảng chưa toàn hệ thống có 123 chi/đảng bộ trực thuộc tại Hà Nội và Thành phố Hồ Chí Minh và hơn 4.500 đảng viên.