Thông báo kết luận cho biết: Một số công ty thành viên của Tổng công ty chưa ban hành quy chế quản lý sử dụng tài sản; chưa xây dựng định mức dự trữ hàng tồn kho; lượng hàng tồn kho lớn gây ứ đọng vốn, ảnh hưởng hoạt động sản xuất kinh doanh. Chưa ban hành quy định về lựa chọn nhà thầu để áp dụng thống nhất trong các hoạt động bảo đảm tính liên tục cho sản xuất, kinh doanh thường xuyên của doanh nghiệp. Một số chi phí không phù hợp với hoạt động kinh doanh, phải loại khỏi chi phí khi xác định trị giá tính thuế.
Hoạt động mua nguyên liệu thuốc lá của nhiều công ty còn một số tồn tại cần được khắc phục sớm để nâng cao hiệu quả sản xuất, kinh doanh (mua nguyên liệu thuốc lá của người trồng theo hình thức mua sô; bán lại nguyên liệu khi không có giấy phép mua bán nguyên liệu; không tổ chức chào hàng cạnh tranh để quyết định giá mua nguyên liệu; hàng tồn kho lớn ảnh hưởng đến hiệu quả hoạt động sản xuất kinh doanh). Công ty sử dụng nguồn phát triển thị trường tổ chức nước ngoài, trong đó nhiều đối tượng không đúng với mục đích. Nguồn gốc một số nguyên liệu thuốc lá của doanh nghiệp tư nhân Tuấn Dung bán cho một số công ty thành viên có dấu hiệu hợp thức hóa nguyên liệu thuốc lá không hợp pháp. Trong quản lý đất đai, một số công ty thành viên chưa hoàn thiện các thủ tục về đất đai đối với diện tích đất được nhà nước cho thuê.
Thanh tra Chính phủ cho biết, trong đầu tư xây dựng, Tổng công ty Thuốc lá Việt Nam đã có sai phạm trong việc thực hiện góp vốn dự án tại 152 Trần Phú (thành phố Hồ Chí Minh) không thực hiện đánh giá lại tài sản là không đúng quy định về quản lý tài sản doanh nghiệp nhà nước; làm trái chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ, vi phạm pháp luật về chuyển nhượng tài sản doanh nghiệp do Nhà nước nắm giữ 100% vốn điều lệ khi chuyển nhượng 30.927,7m2 tại 152 Trần Phú không xin phép Thủ tướng Chính phủ; không thực hiện đấu giá quyền sử dụng đất, có nguy cơ thất thoát tiền của Nhà nước, của doanh nghiệp.
Việc thực hiện dự án tại Nguyễn Trãi, Thanh Xuân Hà Nội đã có một số sai phạm, dự án kéo dài ảnh hưởng đến tiến độ di dời Nhà máy thuốc lá Thăng Long, ảnh hưởng hiệu quả sử dụng vốn của Tổng công ty Thuốc lá.
Kể từ khi Thủ tướng Chính phủ cho phép thực hiện dự án đến thời điểm hiện tại đã hơn 10 năm, nhiều cơ chế chính sách, pháp luật về đất đai, đầu tư, quản lý tài sản nhà nước tại doanh nghiệp đã có sự thay đổi mà thực tế dự án chưa được triển khai, cần phải báo cáo Thủ tướng Chính phủ trước khi tiếp tục thực hiện. Một số dự án đầu tư chậm tiến độ, thủ tục, với việc điều chỉnh nhiều lần ảnh hưởng kết quả sử dụng vốn và hiệu quả sản xuất, kinh doanh.
Thanh tra Chính phủ nêu rõ, nhiều đơn vị, tập thể cần chịu trách nhiệm đối với những vi phạm, khuyết điểm nêu trên. Trong đó có Hội đồng thành viên, Chủ tịch Hội đồng thành viên, Tổng giám đốc, Ban lãnh đạo Tổng công ty Thuốc lá Việt Nam cùng Hội đồng thành viên, Chủ tịch Hội đồng thành viên, Tổng Giám đốc, Ban lãnh đạo một số Công ty trách nhiệm hữu hạn liên quan….
Từ kết quả thanh tra, Tổng thanh tra Chính phủ kiến nghị Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo Bộ Tài chính chỉ đạo Tổng cục Thuế kiểm tra việc kê khai và nộp thuế đối với các trường hợp thu mua nguyên liệu thuốc lá của các hộ nông dân được thực hiện bằng hình thức bản kê để xác định giá tính thuế thu nhập doanh nghiệp phù hợp; xác định lại thuế thu nhập doanh nghiệp đối với doanh nghiệp tư nhân Tuấn Dung do bản kê mua nguyên liệu thuốc lá không phù hợp.
Bộ Công thương chỉ đạo rà soát hoạt động mua, bán nguyên liệu thuốc lá của Công ty cổ phần Hòa Việt, Công ty trách nhiệm hữu hạn một thành viên thuốc lá Sài Gòn, Công ty trách nhiệm hữu hạn một thành viên Viện thuốc lá; xử lý kịp thời các trường hợp vi phạm trong hoạt động kinh doanh nguyên liệu thuốc lá…
Đối với Tổng công ty thuốc lá Việt Nam, Thanh tra Chính phủ đề nghị chỉ đạo Công ty thuốc lá Thăng Long rà soát toàn bộ vốn điều lệ đã điều chỉnh cho Công ty thuốc lá Thăng Long vào số vốn điều lệ đã bổ sung cho các công ty thành viên, trong đó có khoản tiền 73,072 tỷ đồng; rà soát, chấn chỉnh lại toàn bộ hoạt động mua nguyên liệu thuốc lá, bảo đảm thực hiện thống nhất trong toàn bộ các công ty thuộc Tổng công ty, xử lý kịp thời khi phát hiện sai phạm, tiêu cực.
Về xử lý kinh tế, Thanh tra Chính phủ nêu rõ: Tổng Công ty thuốc lá Việt Nam chỉ đạo các đơn vị thành viên thực hiện nộp số tiền thuế thu nhập doanh nghiệp tính thiếu do một số khoản chi không được giảm trừ khi xác định thu nhập chịu thuế số tiền 38.506.511.075 đồng.
Đáng chú ý, Thanh tra Chính phủ kiến nghị Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo Bộ Công an điều tra, xác minh, làm rõ những vụ việc mua bán nguyên liệu của doanh nghiệp tư nhân Tuấn Dung có dấu hiệu của tội trốn thuế.
