Từ chiều 12/9 đến 6 giờ ngày 13/9, lượng mưa phổ biến 50-150mm; Hướng Sơn 223mm, Ba Lòng 218mm. Mực nước sông Ô Lâu, sông Mỹ Chánh, sông Hiếu và sông Thạch Hãn có thời điểm vượt báo động.
Chủ tịch Ủy ban nhân dân xã Lao Bảo Trần Anh Vũ cho biết, nước sông Sê Pôn dâng nhanh từ khoảng 3 giờ ngày 13/9, tràn vào một số khu dân cư thấp trũng, làm 59 hộ bị ngập. Lực lượng biên phòng, quân sự, công an và dân quân đã hỗ trợ di dời 160 hộ, khoảng 700 nhân khẩu đến nơi an toàn từ đêm 12/9 và rạng sáng 13/9.
Mưa lớn cũng gây ngập, tắc giao thông tại nhiều khu vực miền núi phía tây nam tỉnh. Trên các tuyến do Sở Xây dựng quản lý ghi nhận 4 vị trí ngập, tắc, gồm 1 vị trí trên Quốc lộ 15D và 3 vị trí trên đường tỉnh 588a, 586.
Cầu tràn Đakrông trên Quốc lộ 15D ngập 0,6m; cầu tràn Ba Lòng trên đường tỉnh 588a ngập hơn 1m; một số ngầm tràn trên đường tỉnh 586 ngập 10-40cm, xe máy qua lại khó khăn hoặc không thể lưu thông.
Tại các xã La Lay, A Dơi, Đakrông, Trường Sơn và Lìa, nhiều cầu tràn, ngầm tràn ngập 40-70cm, nước chảy xiết, gây chia cắt. Riêng xã Lìa đã bố trí 6 tổ với 18 người chốt chặn tại 5 điểm ngập, bảo đảm an toàn cho người dân và phương tiện.
Ban Chỉ huy phòng thủ dân sự tỉnh Quảng Trị yêu cầu các địa phương tiếp tục theo dõi diễn biến mưa lũ, chủ động di dời người dân ở vùng ven sông, thấp trũng, khu vực có nguy cơ sạt lở; bố trí lực lượng bảo đảm an toàn giao thông, hạn chế thiệt hại do mưa lũ gây ra.