Lượng mưa phổ biến từ 60-100mm, có nơi trên 150mm. Đỉnh lũ trên sông Cái Nha Trang đạt 10,22m; đỉnh lũ trên sông trên sông Dinh Ninh Hòa đạt 5,45m. Nhiều xã trên địa bàn thành phố Nha Trang ngập nặng, như Vĩnh Thái, Vĩnh Phương, Vĩnh Thạnh, Vĩnh Trung, Vĩnh Hiệp, Vĩnh Ngọc. Đường 23 tháng 10, thành phố Nha Trang ngập sâu, phương tiện đi lại khó khăn.
Huyện Khánh Vĩnh nước sông dâng làm ngập 2 cầu, cống qua sông, suối, ngập sâu trung bình từ 0,5m đến 1m. Huyện Diên Khánh có một số khu vực trũng thấp bị ngập như cánh đồng khu vực xã Bình Lộc; khu vực xã Suối Hiệp, xã Diên Điền, xã Diên Phú. Cánh đồng xã Cam Phước Đông, thành phố Cam Ranh ngập một số vị trí trên tuyến Tỉnh lộ 9.
Nhằm bảo đảm an toàn cho người dân, huyện Khánh Vĩnh di dời 25 hộ dân với 115 khẩu; thành phố Nha Trang vận động 13 hộ dân với 51 khẩu ở phường Vĩnh Trường sơ tán đến Nhà Văn hóa phường và nhà của người thân trong khu vực.
Chiều 16/11, tuyến Quốc lộ 27C từ Nha Trang đi Đà Lạt bị sạt lở, chia cắt tại vị trí (km59+790). Giám đốc Sở Giao thông vận tải Khánh Hòa Nguyễn Văn Dần cho biết, hiện các cơ quan, đơn vị có liên quan khẩn trương huy động tối đa nhân lực, máy móc tới hiện trường để thực hiện hốt dọn, giải phóng hiện trường, sớm thông tuyến và cảnh giới giao thông, bảo đảm an toàn giao thông trong khu vực.
Cũng trong chiều 16/11, lãnh đạo UBND xã Ninh Bình (thị xã Ninh Hòa, Khánh Hòa) cho biết, trên địa bàn xảy ra vụ đuối nước làm bé trai Nguyễn Trần Hoàng V (sinh năm 2013, trú tại thôn Bình Trị, xã Ninh Bình) tử vong.
Theo dự báo, đêm 16 và ngày 17/11 trên địa bàn tỉnh Khánh Hòa tiếp tục có mưa to đến rất to.