Đồng thời, Cơ quan an ninh điều tra Bộ Công an đã chuyển toàn bộ hồ sơ vụ án đến Viện Kiểm sát nhân dân Tối cao để truy tố về tội "Chiếm đoạt tài liệu bí mật nhà nước" quy định tại Điều 337 Bộ luật hình sự, đối với bốn bị can: Nguyễn Đức Chung, SN 1967, nguyên Chủ tịch UBND TP Hà Nội, trú tại quận Đống Đa, TP Hà Nội; Phạm Quang Dũng, SN 1983, nguyên cán bộ Công an, huyện Thanh Trì, TP Hà Nội; Nguyễn Hoàng Trung, SN 1983, Chuyên viên Phòng thư ký biên tập, trú tại quận Hai Bà Trưng, TP Hà Nội, Nguyễn Anh Ngọc, SN 1974, nguyên Phó trưởng phòng Thư ký biên tập, trú tại quận Long Biên, TP Hà Nội.
Kết luận điều tra đã được Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an tống đạt đến các bị can và chuyển Viện Kiểm sát nhân dân Tối cao để truy tố theo quy định của pháp luật.
Trước đó, cuối tháng 8-2020, Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an ra quyết định khởi tố bị can, lệnh bắt tạm giam, lệnh khám xét chỗ ở và nơi làm việc đối với ông Nguyễn Đức Chung về hành vi chiếm đoạt tài liệu bí mật Nhà nước.
Ông Nguyễn Đức Chung có trách nhiệm trong các vụ việc liên quan Nhật Cường, xử lý nước hồ ô nhiễm 
Khởi tố, bắt tạm giam ông Nguyễn Đức Chung 
