Ngay sau khi về đến thành phố Hà Giang, tất cả công dân được đưa về Trung đoàn 877, phường Ngọc Hà, thành phố Hà Giang để lấy mẫu xét nghiệm SARS-CoV-2. Sau khi lấy mẫu xét nghiệm, ngay trong ngày, các địa phương thuê xe ô – tô đưa công dân về các khu cách ly tập trung tại các huyện, thành phố để thực hiện cách ly 14 ngày.
Trong thời gian cách ly, người dân được nhà nước nuôi ăn, ở miễn phí, được cung cấp một số vật dụng cá nhân cần thiết.
Theo chỉ đạo của tỉnh, các huyện, thành phố đã chủ động kinh phí để mua sắm trang thiết bị phục vụ cán bộ và người lao động trong các khu cách ly; tiến hành sửa chữa hệ thống điện chiếu sáng, quạt mát, hợp đồng cung cấp suất ăn hằng ngày tại các khu cách ly.