Trong ngày đầu tiên vận hành, tuyến đường sắt đô thị hoạt động từ 8 giờ đến 22 giờ. Tàu chạy 109 lượt. Hệ thống lợi dụng sức chứa tàu đạt 37,8%.
Trong 15 ngày đầu vận hành, các chuyến tàu sẽ phục vụ người dân miễn phí. Ga tàu Cát Linh - Hà Đông mở cửa từ 5 giờ 30 phút và đóng cửa vào 20 giờ hằng ngày. Khi khai thác thương mại có thu tiền, tuyến đường hoạt động từ 5 giờ 30 phút và kết thúc vào 22 giờ 30 phút hằng ngày.
Ở khung giờ cao điểm, các đoàn tàu chạy giãn cách với tần suất 6 phút có một đoàn tàu cập ga, sức chở tối đa 960 người/đoàn. Trong giờ bình thường tàu được khai thác 10 phút/chuyến. Lưu lượng vận chuyển tối đa đạt 1,02 triệu người/ngày.
Năm đầu tiên đưa vào hoạt động, dự án 2A Cát Linh - Hà Đông được chia làm hai giai đoạn vận hành. Cụ thể, 6 tháng đầu có 6 tàu chạy. 6 tháng sau, có 9 đoàn tàu chạy, đạt 100% công suất.