Trước đó, vào khoảng 15 giờ 10 phút ngày 25/6, trên khu vực biển phía nam cách Côn Đảo khoảng 110 hải lý, lực lượng chức năng của Bộ Tư lệnh Vùng Cảnh sát biển 3 đã phát hiện tàu cá số hiệu TG 92008TS có dấu hiệu nghi vấn nên tiến hành kiểm tra.
Tại thời điểm kiểm tra, trên tàu có 5 thuyền viên do ông Nguyễn Ngọc Đức (sinh năm 1971, thường trú tại phường 2, TP Mỹ Tho, tỉnh Tiền Giang) làm thuyền trưởng. Theo lời khai ban đầu của ông Đức, tàu đang vận chuyển khoảng 85.000 lít dầu DO, số dầu trên được mua từ một tàu không rõ số hiệu; không có hóa đơn, giấy tờ liên quan chứng minh nguồn gốc của hàng hóa. Thuyền trưởng và các thuyền viên không có chứng chỉ chuyên môn theo quy định.
Lực lượng chức năng của Bộ Tư lệnh Vùng Cảnh sát biển 3 đã tiến hành lập biên bản vi phạm hành chính, đưa tàu về cảng để xử lý theo đúng quy định pháp luật.