Báo cáo tại Phiên họp thứ 31 của Ủy ban Thường vụ Quốc hội, Bộ Tài chính cho biết, quá trình vận hành hoạt động kiểm tra, giám sát hải quan được thực hiện theo hệ thống pháp lý xây dựng trên nền tảng hệ thống thông quan hàng hóa tự động/hệ thống thông tin tình báo hải quan (VNACCS/VCIS) do Nhật Bản tài trợ (vận hành từ năm 2014) và các hệ thống vệ tinh do ngành Hải quan xây dựng nhưng chưa lường trước được xu hướng tự do hóa thương mại toàn cầu, chưa dự báo được sự gia tăng không ngừng của kim ngạch xuất, nhập khẩu dẫn đến giải quyết công việc còn một số tồn tại, hạn chế.