Từ việc đóng vai trò nòng cốt, thúc đẩy hệ thống giáo dục sau đại học cho đến quá trình trở thành một trong những đơn vị đầu tiên được Đại học Quốc gia Hà Nội giao nhiệm vụ triển khai các chương trình đào tạo mang tính chất liên lĩnh vực, Khoa Các khoa học liên ngành đã từng bước tạo dựng các giá trị và nền tảng cốt lõi, làm cơ sở vững chắc để hình thành Trường Khoa học liên ngành và Nghệ thuật.