Ngày 11-3-2005, Thủ tướng Chính phủ đã ký ban hành Quyết định số 51 phê duyệt Quy hoạch Khu kinh tế vịnh Vân Phong, tỉnh Khánh Hòa đến năm 2020.
Phạm vi quy hoạch Khu kinh tế vịnh Vân Phong thuộc hai huyện Vạn Ninh và Ninh Hòa, tỉnh Khánh Hòa.
Khu kinh tế vịnh Vân Phong là khu kinh tế tổng hợp, trong đó cảng trung chuyển container quốc tế giữ vai trò chủ đạo kết hợp phát triển kinh tế tổng hợp đa ngành, đa lĩnh vực gồm du lịch, dịch vụ công nghiệp, nuôi trồng thủy sản và các ngành kinh tế khác. Khu kinh tế vịnh Vân Phong có tổng diện tích quy hoạch khoảng 150.000 ha, gồm diện tích phần mặt nước khoảng 80.000 ha, phần đất liền khoảng 70.000 ha, trong đó đất sử dụng cho xây dựng khoảng 8.000 ha-10.000 ha.
Theo quyết định, các dự án ưu tiên đầu tư xây dựng đợt đầu: Cảng trung chuyển container quốc tế, công suất 0,5 triệu TEU; đường vận tải từ quốc lộ 1A đến Đầm Môn, đường sắt vào cảng; hồ chứa nước Hoa Sơn, hồ Đồng Điện Nam và hồ Tiên Du; nhánh rẽ cáp ngầm 110kV và trạm 110kV tại Đầm Môn ; cảng chuyển tải dầu, công suất 1,5-2,0 triệu tấn; tổng kho xăng dầu Mỹ Giang, công suất 0,5 triệu tấn; cảng hành khách quốc tế Đầm Môn, công suất 1,0 triệu lượt hành khách/năm và các dự án dịch vụ, bưu chính, viễn thông, thương mại, du lịch, dự án trồng rừng tái sinh, rừng ngập mặn...
