Từ năm 2002 đến nay, các cấp uỷ đảng và chính quyền trong tỉnh Ninh Bình đã quan tâm đầu tư gần 660 tỷ đồng để xây dựng các trạm y tế xã, phường. Toàn tỉnh hiện có gần 130/146 xã, phường, thị trấn đạt chuẩn quốc gia về y tế, trong đó ba huyện có 100% trạm y tế xã, phường đạt chuẩn quốc gia.
Các bệnh viện tuyến tỉnh bao gồm: Bệnh viện mắt, Bệnh viện tâm thần, Bệnh viện lao và bệnh phổi, Y học cổ truyền, Bệnh viện điều dưỡng- phục hồi chức năng.v.v. đều được đầu tư, nâng cấp. Các Trung tâm y tế huyện, phòng khám đa khoa khu vực được trang bị máy siêu âm màu, 3D, 4D, máy X quang, máy nội soi dạ dày, xét nghiệm sinh hoá .v.v có công nghệ hiện đại. Ngoài ra, các bệnh viện, trung tâm y tế trong tỉnh Ninh Bình có hơn 3.500 nhân viên y tế trong đó, gần 200 bác sỹ, 10 dược sỹ đại học và hơn 1.600 nhân viên y tế thôn bản.
