Theo kết luận của UBKT Tỉnh ủy Phú Yên, ông Ngô Quang Phú cùng tập thể lãnh đạo sở chậm triển khai thực hiện kết luận của Ban Thường vụ Tỉnh ủy về rà soát quy hoạch, hướng thực hiện quy hoạch trục đường Hùng Vương, TP Tuy Hòa; quyết định của UBND tỉnh về phê duyệt kết quả rà soát quỹ đất quy hoạch, hướng quy hoạch công trình công cộng dọc theo hai bên đường Hùng Vương; chỉ đạo thực hiện, báo cáo có một số nội dung không đúng thực tế có trong hồ sơ kiểm tra.
Ông Phú đã tham mưu ban hành kết luận kiểm tra, kiến nghị UBND tỉnh không thu hồi ba dự án, cho phép chuyển nhượng quyền sử dụng đất không có cơ sở. Ông Phú biết nhưng không ngăn chặn để Giám đốc Văn phòng Ðăng ký đất đai thụ lý hồ sơ, ký, cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất không đúng quy định của pháp luật, chủ trương của tỉnh. Mặt khác, ông Phú còn tham mưu Giám đốc Sở TN và MT trình UBND tỉnh quyết định cho nhà đầu tư thuê đất thực hiện một số dự án chưa có trong quy hoạch sử dụng đất được cơ quan có thẩm quyền phê duyệt.
Cũng theo kết luận của UBKT, trong thời gian giữ chức Chi cục phó Chi cục Quản lý đất đai (thuộc Sở TN và MT) , ông Nguyễn Vũ Thụy đã tham mưu lãnh đạo sở trình UBND tỉnh quyết định giao đất, cho thuê đất nhiều dự án liên quan đến việc chuyển mục đích sử dụng rừng, đất rừng không đúng quy định pháp luật về đất đai, bảo vệ, phát triển rừng. Ông Thụy không kịp thời tham mưu lãnh đạo sở kiểm tra, đôn đốc hướng dẫn nhà đầu tư hoàn tất các thủ tục đất đai trước khi triển khai thực hiện dự án. Khi kiểm tra, phát hiện nhiều dự án vi phạm pháp luật về đất đai nhưng ông Thụy tham mưu, đề xuất xử lý không kịp thời, chưa đúng quy định. Ngoài ra, ông Nguyễn Vũ Thụy đã thụ lý hồ sơ, ký, cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất một trường hợp không đúng quy định pháp luật, chủ trương của tỉnh.
