Trước đó, khoảng hơn 14 giờ ngày 28/7, tàu SE11 đang trên đường từ Hà Nội vào Thành phố Hồ Chí Minh khi đến tại đoạn đường sắt ở thị trấn Lăng Cô, huyện Phú Lộc (Thừa Thiên Huế) bị trật bánh tại toa số 10, số 11, trong đó toa số 10 là toa hành khách.
Ngay khi xảy ra sự cố, lực lượng chức năng điều phối của Tổng Công ty Đường sắt Việt Nam đã phối hợp điều tiết các đoàn tàu trên tuyến bắc-nam, khẩn trương khắc phục sự cố. Cán bộ kỹ sư đường sắt đã nhanh chóng tách hai toa tàu bị trật bánh ra khỏi đường ray, thay thế bằng hai toa tàu khác. Sau khoảng hơn 2 giờ đồng hồ, tàu SE11 đã lưu thông bình thường.