Theo đơn vị thi công (Công ty cổ phần Đầu tư Xây dựng Trung Nam), nhiều hạng mục của dự án đã đạt hơn 90% như: cống kiểm soát triều Bến Nghé (quận 1) đạt 92%, cống Tân Thuận (quận 7) đạt 93%, cống Phú Xuân (huyện Nhè Bè) đạt 95%, cống Mương Chuối (huyện Nhè Bè), đạt 90%,…
Được khởi công từ giữa năm 2016, dự án dự kiến hoàn thành vào tháng 4/2018 nhưng sau đó phải ngưng thi công 10 tháng và điều chỉnh thời gian hoàn thành đến tháng 6/2019 do vướng mắc liên quan việc tái cấp vốn.
Dự án được tái khởi động vào tháng 2/2019, dự kiến đưa vào vận hành trong quý I/2020.
Tuy nhiên, đến giữa tháng 11/2020, dự án tiếp tục phải ngưng thi công do UBND TP Hồ Chí Minh chưa ký phụ lục hợp đồng BT (xây dựng - chuyển giao) gia hạn thời gian thực hiện dự án (hết hạn từ tháng 6/2020).
Tháng 4/2021, Thủ tướng ký Nghị quyết 40 về việc gỡ vướng, để tiếp tục triển khai dự án theo cơ chế đặc thù nhằm bảo đảm lợi ích kinh tế, tránh lãng phí nguồn lực đã đầu tư.
Theo đó, về vốn đầu tư, Ủy ban nhân dân TP Hồ Chí Minh thống nhất với các Ngân hàng cấp vốn về việc tái cấp vốn vay thực hiện dự án. TP Hồ Chí Minh chịu trách nhiệm khắc phục tối đa tồn tại pháp lý đang vướng mắc; hiệu quả chống ngập của dự án; không để tiêu cực, thất thoát...
Hiện Trung Nam cũng đang chờ Ủy ban nhân dân TP Hồ Chí Minh hoàn tất các thủ tục ký kết phụ lục hợp đồng gia hạn thời gian hoàn thành để tiếp tục thi công dự án.
Tại phiên họp thường kỳ Chính phủ tháng 6/2021, khi nhắc đến một số dự án trọng điểm đang chậm tiến độ (tuyến đường sắt trên cao Cát Linh - Hà Đông; dự án Giải quyết ngập do triều khu vực TP Hồ Chí Minh có xét đến yếu tố biến đổi khí hậu (giai đoạn 1);…) Thủ tướng Phạm Minh Chính yêu cầu các bộ, cơ quan, địa phương phải chủ động, nỗ lực giải quyết các nhiệm vụ tồn đọng theo tinh thần “làm việc nào dứt điểm việc đó; không để các vụ việc, dự án kéo dài dây dưa.
