Hoạt động du lịch ở chùa Hương hiện có nhiều khởi sắc, cơ sở hạ tầng được cải thiện, nhiều cơ sở lưu trú mới đi vào hoạt động, dịch vụ phát triển, lượng khách đến chùa Hương trẩy hội, tham quan du lịch mỗi năm một đông hơn.
Năm 1996, chùa Hương đón 342.500 lượt khách, doanh thu đạt 62,8 tỷ đồng thì đến năm 2002, khách du lịch đã tăng lên 357.500 khách, doanh thu xã hội đạt 84 tỷ đồng, tăng 33%. Tuy nhiên, do lượng khách ngày càng tăng, cơ sở hạ tầng chưa được đầu tư nâng cấp thường xuyên, công tác quản lý di tích, lễ hội nhiều tồn tại như tình trạng ách tắc giao thông trong những ngày diễn ra lễ hội, nguy cơ ô nhiễm môi trường sinh thái, rừng bị xâm hại, kinh doanh dịch vụ chưa được quản lý chặt chẽ, tình trạng chèo kéo, tranh giành, bắt chẹt, ép giá khách diễn ra nhiều, an ninh trật tự chưa được bảo đảm, do đó sự phát triển du lịch ở chùa Hương thiếu bền vững, chưa khai thác được tiềm năng, lợi thế vốn có của khu di tích danh thắng.
Thực hiện chương trình hành động quốc gia về du lịch và để góp phần đưa du lịch trở thành một ngành kinh tế mũi nhọn của tỉnh, Sở du lịch Hà Tây đã tham mưu cho UBND tỉnh khai thác nguồn vốn đầu tư hạ tầng du lịch của Chính phủ để đầu tư xây dựng các công trình hạ tầng du lịch như giao thông, vệ sinh môi trường, công trình công cộng.
Trong ba năm 2001 - 2003, ngành du lịch tiến hành lập và được duyệt 14 dự án hạ tầng du lịch ở ba cụm du lịch trọng điểm của tỉnh với tổng vốn đầu tư hơn 285 tỷ đồng. Ðến nay, vốn đầu tư đã được cấp là 63,8 tỷ đồng, trong đó riêng khu du lịch chùa Hương là 29 tỷ đồng.
Ðến nay đã và đang có bốn dự án triển khai khu du lịch chùa Hương: Làm đường cầu Hội - Hương Sơn và các bến xe, thu gom xử lý rác thải rắn; cải tạo tránh ách tắc giao thông đường thủy, vệ sinh môi trường, cảnh quan suối Yến và dự án đường hai bờ suối Yến. Công trình đường cầu Hội - Hương Sơn và các bến xe gồm ba hạng mục: Ðường cầu Hội - Hương Sơn dài 1.410m; bến xe ô-tô Ðục Khê rộng 12.500m2 có nhà điều hành, nhà vệ sinh, nhà chờ, nhà bảo vệ, đèn chiếu sáng và bến xe ô- tô, rộng 9.005m2 đã được đầu tư xây dựng từ cuối năm 2001, hoàn thành tháng 3-2002 với vốn đầu tư 11,7 tỷ đồng. Công trình thu gom xử lý rác thải rắn gồm các hạng mục thùng chứa rác, pa-nô truyền thông vệ sinh môi trường cũng được đầu tư 500 triệu đồng, hoàn thành vào tháng 2-2002.
Năm 2002, công trình cải tạo tránh ách tắc giao thông đường thủy, vệ sinh môi trường, cảnh quan suối Yến giai đoạn một tiếp tục được triển khai đầu tư xây dựng nhằm mục tiêu cải tạo, nâng cấp lại dòng suối Yến, mở rộng các bến thuyền, cải tạo cảnh quan môi trường và tạo thêm quỹ đất, tổ chức dịch vụ cho khách, giảm tải hệ thống dịch vụ tại các bến thuyền. Cải tạo bến Yến, bến Trò và nạo vét suối Yến với vốn đầu tư là 16,795 tỷ đồng. Sau gần một năm thi công, đến nay, các hạng mục cải tạo bến Yến, cải tạo bến Trò đã cơ bản hoàn thành, hạng mục nạo vét suối Yến đã triển khai nạo vét được gần 1.500 m chiều dài tuyến suối ở hai đầu bến, còn lại hơn 3.000 m chiều dài tuyến suối sẽ triển khai tiếp sau hội xuân 2004.
Bên cạnh đó, được sự đồng ý của Tỉnh ủy và UBND tỉnh, để bảo đảm đồng bộ một số kết cấu hạ tầng kỹ thuật thiết yếu phục vụ lễ hội, ngành du lịch đang tiếp tục thực hiện đầu tư một số hạng mục giai đoạn hai của dự án cải tạo suối Yến và dự án cải tạo đường hai bờ suối Yến từ cầu Yến Vĩ vào đền Trình theo phương thức đấu thầu, nhà thầu trúng thầu phải tự ứng vốn thi công không tính lãi, khi nào có vốn thanh toán sau.
Công trình cải tạo suối Yến giai đoạn hai gồm hạng mục kè, cải tạo hoàn thiện bến Yến kéo dài vào đền Trình và cải tạo nền, mặt bến Trò có vốn đầu tư hơn 6 tỷ đồng. Công trình đường hai bờ suối Yến gồm hai tuyến đường ven bờ suối Yến, tổng chiều dài 1.023m, vốn đầu tư hơn ba triệu đồng. Sau khi cải tạo bước đầu, hiện nay dòng suối Yến đã được trả lại vẻ đẹp trong xanh, thoáng đãng với các bến thuyền bề thế. Cảnh ách tắc thuyền đò trên dòng suối, cảnh chen lấn xô đẩy tại bến Yến, bến Trò sẽ được cải thiện đáng kể.
Cùng với việc triển khai đầu tư xây dựng các công trình hạ tầng du lịch, những năm qua, ngành du lịch Hà Tây đã chủ động triển khai công tác nâng cao chất lượng dịch vụ, tạo điều kiện thuận lợi cho khách tham quan du lịch lễ hội chùa Hương và phối hợp UBND huyện Mỹ Ðức tổ chức hơn mười lớp tập huấn về văn hóa du lịch cho các đối tượng tham gia phục vụ du lịch của xã Hương Sơn, đội ngũ chèo đò vận chuyển khách, các hộ kinh doanh dịch vụ.
Ngành du lịch cũng đã triển khai lắp đặt pa-nô quảng bá du lịch trên các tuyến đường dẫn vào chùa Hương. Hằng năm đều xây dựng kế hoạch thanh tra, kiểm tra hoạt động dịch vụ du lịch trong mùa lễ hội, qua đó chấn chỉnh các hoạt động du lịch còn có tiêu cực, thiếu lành mạnh; tăng cường công tác quản lý nhà nước về du lịch. Ngành đang xây dựng và triển khai đề án đổi mới tổ chức sắp xếp vận chuyển đò suối Yến, tiến tới có các giải pháp quản lý đò vận chuyển khách thuận tiện và khoa học, hình thành thái độ ứng xử văn minh, lịch sự của đội ngũ chèo đò, phát triển đồng bộ khu du lịch cả về cơ sở vật chất kỹ thuật, cảnh quan môi trường sinh thái và đội ngũ làm du lịch.
