Đơn vị thực hiện xét nghiệm là Trung tâm Kiểm soát bệnh tật TP Đà Nẵng với loại mẫu xét nghiệm là mẫu gộp 10.
Tất cả thí sinh đến địa điểm dự thi lấy mẫu xét nghiệm tuân thủ nghiêm việc đeo khẩu trang, giãn cách, đo thân nhiệt và rửa tay sát khuẩn. Các giáo viên hướng dẫn thí sinh khai báo y tế tại phòng thi và di chuyển về khu vực lấy mẫu theo khung giờ giãn cách.
Riêng số thí sinh thuộc diện trong khu cách ly, phong tỏa liên quan đến dịch Covid-19 được lấy mẫu xét nghiệm ngay tại khu vực cách ly và được xe đưa đón đến tận điểm thi riêng theo quy định.
Để chuẩn bị tốt cho kỳ thi, Đà Nẵng tổ chức xét nghiệm cho toàn bộ những người tham gia kỳ thi, gồm cán bộ, giáo viên, nhân viên, công an, bảo vệ, thanh tra, tình nguyện viên, thí sinh tham, tổng số gần 16.226 người. Trong đó, 54 người thuộc tổ công tác nhận đề, Ban in sao đề kỳ thi tốt nghiệp THPT; khoảng 3.456 người là thanh tra thi, Ban vận chuyển, thanh tra Bộ GD-ĐT, Ban thư ký Ban làm phách, cán bộ coi thi, tình nguyện viên, công an, bảo vệ, nhân viên phục vụ tại tất cả các điểm thi; 12.716 người thí sinh. Tổ công tác nhận đề, Ban in sao đề kỳ thi tốt nghiệp THPT xét nghiệm vào ngày 25-6; thí sinh, lãnh đạo, thư ký, cán bộ coi thi, thanh tra thi, công an, bảo vệ, tình nguyện viên, y tế, nhân viên phục vụ tại các điểm thi xét nghiệm vào ngày 4-7 tại các điểm thi và Thanh tra Bộ GD-ĐT, Ban Vận chuyển, Ban thư ký, Ban làm phách, Ban chấm thi, thanh tra thi, cán bộ coi thi dự phòng và công an, bảo vệ, nhân viên khác phục vụ kỳ thi xét nghiệm ngày 5-7 tại Trường THPT Phan Châu Trinh.
Kỳ thi tốt nghiệp THPT năm 2021 Đà Nẵng tổ chức tại có 31 điểm thi với 550 phòng thi. Trong đó, điểm thi Trường THPT Võ Chí Công, quận Ngũ Hành Sơn (có 12 phòng thi) dành cho các thí sinh thuộc diện F do liên quan đến dịch Covid-19.
