Chuyến bay được thực hiện theo hình thức bay thương mại với đông đảo hành khách trên hành trình từ Hà Nội đi Tokyo.
Đại sứ Việt Nam tại Nhật Bản Vũ Hồng Nam và Phu nhân cùng một số cán bộ, nhân viên Đại sứ quán đón Chủ tịch nước Nguyễn Xuân Phúc và đoàn tại sân bay.
Nhật Bản sẽ tổ chức Quốc tang cố Thủ tướng Abe Shinzo vào ngày 27/9. Đây là lần thứ hai kể từ sau Chiến tranh Thế giới thứ 2, Chính phủ Nhật Bản quyết định tổ chức Quốc tang cho một cựu Thủ tướng (lần đầu tiên là cố Thủ tướng Yoshida Shigeru vào năm 1967). Dự kiến sẽ có khoảng 6.000 quan khách nước ngoài tham dự sự kiện này, trong đó có các nguyên thủ quốc gia, người đứng đầu chính phủ và đại diện lãnh đạo các nước.
Theo chương trình, Chủ tịch nước Nguyễn Xuân Phúc và đoàn cấp cao Việt Nam sẽ dự Lễ Quốc tang của cố Thủ tướng Abe Shinzo; Hội đàm với Thủ tướng Nhật Bản Kishida Fumio; gặp Chủ tịch Hạ viện, Chủ tịch Thượng viện Nhật Bản; dự cuộc tiếp của Nhà vua Nhật Bản tiếp Trưởng đoàn các nước; tiếp Chủ tịch liên minh Nghị sĩ hữu nghị Nhật-Việt và cựu Thủ tướng Suga Yoshihide; gặp gỡ thống đốc một số địa phương; gặp gỡ các cựu Đại sứ Nhật Bản tại Việt Nam; tiếp xúc song phương với lãnh đạo một số quốc gia dự Lễ Quốc tang; gặp Chủ tịch Hội đồng châu Âu; đại diện trí thức Việt Nam tiêu biểu tại Nhật Bản.
Việc Chủ tịch nước Nguyễn Xuân Phúc thay mặt lãnh đạo Đảng và Nhà nước Việt Nam dự Lễ Quốc tang cố Thủ tướng Nhật Bản Abe Shinzo thể hiện sự ghi nhận, trân trọng tình cảm đặc biệt và sự ủng hộ, hỗ trợ quý báu mà cố Thủ tướng Abe Shinzo dành cho đất nước, con người Việt Nam cũng như quan hệ hợp tác hữu nghị Việt Nam-Nhật Bản, đồng thời thể hiện Việt Nam luôn trân trọng và tình nghĩa với bạn bè quốc tế.
