Ngay sau khi bị bắt, cơ quan điều tra đã tiến hành di lý Mạnh từ tỉnh Đác Lắc xuống trại tạm giam Quân khu 5 tại Đà Nẵng để phục vụ công tác điều tra.
Theo điều tra ban đầu, trong quá trình làm ăn, ông N.V.Đ, trú tại huyện Krông Năng có thế chấp một số tài sản để vay 800 triệu đồng tại Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển nông thôn (Agribank) chi nhánh Nơ Trang Long, TP Buôn Ma Thuột, tỉnh Đác Lắc. Mặc dù đã đến thời hạn thanh toán nhưng ông Đ không trả nợ khoản vay này. Vào khoảng đầu năm 2011, Agribank chi nhánh Nơ Trang Long đã làm đơn khởi kiện ra TAND huyện Krông Năng buộc ông Đ phải trả nợ cho Agribank.
Sau khi xem xét hồ sơ vụ việc, TAND huyện Krông Năng đã thụ lý vụ kiện dân sự về tranh chấp hợp đồng vay giữa Agribank chi nhánh Nơ Trang Long và bị đơn là ông Đ, trong đó ông Mạnh được giao làm thư ký vụ án này.
Vào giữa năm 2011, TAND huyện Krông Năng tổ chức buổi hòa giải giữa đại diện Agribank chi nhánh Nơ Trang Long (nguyên đơn) và ông Đ (bị đơn), cùng bà A (vợ ông Đ) là người có quyền lợi nghĩa vụ liên quan.
Tại biên bản hòa giải thành giữa các bên đương sự, ông Đ chấp nhận thanh toán khoản nợ vay cho phía ngân hàng. Qua xác minh tài sản, vợ chồng ông Đ, bà A có tài sản chung là nhà và đất với diện tích 300 m2. Vì vậy, ông Đ chỉ dùng phần tài sản riêng để trả nợ. Còn bà A do không hề biết khoản vay này cũng như không sử dụng số tiền này nên không có trách nhiệm phải trả nợ.
Sau khi tập hợp hồ sơ, thư ký Nguyễn Hữu Mạnh đã có hành vi tự ý sửa chữa, viết thêm vào biên bản hòa giải tài sản chung của vợ chồng ông Đ thành tài sản riêng của ông Đ. Căn cứ vào biên bản hòa giải thành do Mạnh sửa chữa, TAND huyện Krông Năng đã ra quyết định công nhận sự thỏa thuận giữa các bên đương sự.
Vì vậy, trong quá trình thi hành án, toàn bộ tài sản chung của vợ chồng ông Đ và bà A gồm nhà và đất có diện diện tích hơn 300 m2 ở huyện Krông Năng đã bị kê biên, bán đấu giá được hơn 600 triệu đồng để trả nợ cho người được thi hành án là Agribank chi nhánh Nơ Trang Long.
Hành vi sai phạm của thư ký Nguyễn Hữu Mạnh đã ảnh hưởng đến quyền lợi của bà A.
Vụ việc đang được Cơ quan điều tra Viện Kiểm sát nhân dân Tối cao khu vực miền trung - Tây Nguyên tiếp tục điều tra, làm rõ.
