Liên hiệp hợp tác xã có mục tiêu xây dựng hệ thống vùng nguyên liệu của các hợp tác xã thành viên nhằm ổn định về mặt chất lượng sản phẩm và truy xuất được nguồn gốc sản phẩm; xây dựng bộ quy trình sản xuất lúa, gạo an toàn...