Trước đó, vào lúc gần 18 giờ chiều 21/2, tàu khách bắc-nam mang số hiệu SE7 chạy từ Thủ đô Hà Nội vào Thành phố Hồ Chí Minh khi đến Km537+700 (khu gian Lệ Kỳ-Long Đại) đoạn qua xã Hiền Ninh, huyện Quảng Ninh thì bị 1 nhóm trẻ từ bên đường ném đá lên làm vỡ lớp ngoài 4 tấm kính cửa sổ (3 tấm kính cố định ở toa 31483, 31616 và 1 tấm kính di động ở toa 11462) gây ảnh hưởng hành trình chạy tàu.
Sự việc tuy không gây thương tích nhưng cũng khiến nhiều hành khách hoảng sợ.
Sau đó, Trưởng tàu SE7 cho đoàn tàu dừng tại ga Mỹ Đức, huyện Lệ Thủy để lập biên bản về sự việc và phối hợp các đơn vị quản lý đường sắt và chính quyền địa phương xác minh, xử lý.
Nhận được tin báo, Công an huyện Quảng Ninh đã cử lực lượng điều tra và phát hiện nhóm đối tượng liên quan đến vụ việc là 9 học sinh ở các xã miền núi huyện Quảng Ninh, tuổi từ 12 đến 13 đã thừa nhận hành vi ném đá lên tàu hỏa.
Hiện, lãnh đạo Công an huyện Quảng Ninh chỉ đạo Công an xã Hiền Ninh lập hồ sơ, xử lý nhóm trẻ gây ra sự việc.
