Sáu bị can bị khởi tố gồm: Lâm Hồng Trinh (nguyên Phó Tổng giám đốc); Ðỗ Hoàng Linh (nguyên Phó Tổng giám đốc); Ngô Trí Ðức (nguyên Phó Tổng giám đốc); Hồ Trọng Thắng (nguyên Trưởng phòng Quản lý tín dụng); Trần Thị Hồng Phương (nguyên Giám đốc khối kế toán); Phạm Thị Quỳnh Ngân (nguyên Trưởng phòng Pháp chế). Theo điều tra, các nghi can Trinh, Linh, Ðức với cương vị của mình đã ký duyệt hồ sơ vay vốn tổng số tiền 650 tỷ đồng cho hai công ty sân sau của Phạm Công Danh (nguyên Chủ tịch Hội đồng quản trị Ngân hàng VNCB) trên hồ sơ vay của TrustBank Chi nhánh Sài Gòn thẩm định, đề nghị cho vay, gây thiệt hại cho TrustBank 471 tỷ đồng. Các nghi can: Thắng, Phương, Ngân đã thẩm định hồ sơ không đúng quy định, giải ngân, gây thiệt hại cho TrustBank.
Liên quan vụ án, tháng 11-2017, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã khởi tố bị can và bắt tạm giam Hoàng Văn Toàn (nguyên Chủ tịch Hội đồng quản trị TrustBank); Trần Sơn Nam (nguyên Tổng giám đốc TrustBank); Ngô Kim Huệ (nguyên Phó Tổng giám đốc TrustBank) về tội "Cố ý làm trái quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng".
Tiếp đó, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã khởi tố 14 bị can nguyên là cán bộ TrustBank về các hành vi "Lạm dụng tín nhiệm chiếm đoạt tài sản" và "Cố ý làm trái quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng".