Học viện Phật giáo Nam tông Khmer có tổng diện tích xây dựng hơn 6,7 ha, gồm 19 hạng mục như: chánh điện, khu hiệu bộ, giảng đường, thư viện, tăng xá, nhà trưng bày… với dự toán tổng kinh phí là 451 tỷ đồng, chia làm ba giai đoạn. Đến nay, việc xây dựng giai đoạn 1 khu hiệu bộ đã hoàn tất, tạo điều kiện thuận lợi cho các tăng sinh tu học.
Năm 2006, Học viện Phật giáo Nam tông Khmer tại TP Cần Thơ được thành lập, là một trong bốn học viện trực thuộc Giáo hội Phật giáo Việt Nam. Đến nay, Học viện đã đào tạo được 5 khóa, với hơn 200 tăng sinh tốt nghiệp cử nhân Phật học, góp phần nâng cao trình độ tăng sinh, các vị sư sãi ở các chùa Khmer khu vực Tây Nam Bộ.
