Ðến dự lễ khai mạc có các đồng chí: nguyên Tổng Bí thư Lê Khả Phiêu; nguyên Phó Chủ tịch nước Nguyễn Thị Bình; các đồng chí Ủy viên T.Ư Ðảng: Phó Thủ tướng Nguyễn Thiện Nhân, Chủ tịch Ủy ban T.Ư MTTQ Việt Nam Huỳnh Ðảm; Bộ trưởng Tài nguyên và Môi trường Phạm Khôi Nguyên. Nguyên Tổng Bí thư Ðỗ Mười gửi lẵng hoa chúc mừng; Ðại tướng Võ Nguyên Giáp gửi thư mừng đến đại hội.
Sau lời khai mạc của Giáo sư Nguyễn Trọng Nhân, Phó Chủ tịch VAVA, Ðại hội đã nghe Phó Chủ tịch kiêm Tổng Thư ký VAVA, Giáo sư Trần Xuân Thu trình bày Báo cáo của Ban Chấp hành nhiệm kỳ 1 (2004 - 2008) nêu rõ sự phát triển của tổ chức hội và hội viên, việc chăm lo, trợ giúp hàng trăm nghìn nạn nhân chất độc da cam trong cả nước, diễn biến vụ kiện dân sự VAVA đang tiến hành ở Mỹ đối với 37 công ty hóa chất Mỹ vì quyền sống và công lý cho các nạn nhân chất độc da cam/dioxin Việt Nam; đề xuất một số giải pháp để nhiệm kỳ 2 (2009 - 2013) tiếp tục chăm sóc, hỗ trợ các nạn nhân, đi tới cùng trong vụ kiện dân sự cho đến khi công lý giành được chiến thắng.
Thay mặt Ðảng và Nhà nước, Phó Thủ tướng Nguyễn Thiện Nhân đã phát biểu ý kiến biểu dương và đánh giá cao hiệu quả hoạt động thiết thực của VAVA trong việc chăm sóc, hỗ trợ các nạn nhân; đề xuất và kiến nghị với cơ quan Nhà nước những chính sách, chế độ đúng và phù hợp các nạn nhân, kiên trì cuộc đấu tranh đòi công bằng và công lý, đòi quyền sống cho các nạn nhân chất độc da cam Việt Nam. Phó Thủ tướng cũng khen ngợi các nạn nhân, nhờ sự giúp đỡ của Nhà nước, cộng đồng xã hội và của VAVA, đã nỗ lực vượt khó làm ăn, tự bảo đảm cuộc sống của mình.
Ðại hội đã nghe các đồng chí Huỳnh Ðảm, Chủ tịch Ủy ban T.Ư MTTQ Việt Nam; Phạm Khôi Nguyên, Bộ trưởng Tài nguyên và Môi trường; đại diện một số tỉnh hội, thành hội trong cả nước; một số vị khách nước ngoài có tấm lòng yêu mến, giúp đỡ các nạn nhân chất độc da cam Việt Nam phát biểu ý kiến chào mừng, cam kết tiếp tục phối hợp và cộng tác với VAVA trong việc chăm sóc, hỗ trợ các nạn nhân, khẳng định tiếp tục sát cánh cùng VAVA trong cuộc đấu tranh đòi công bằng và công lý.
Ðại hội đại biểu toàn quốc lần thứ hai của VAVA đã bầu Ban Chấp hành nhiệm kỳ hai (2009 - 2013) gồm 87 vị; Ban Chấp hành nhiệm kỳ hai đã bầu đồng chí Thượng tướng Nguyễn Văn Rinh, nguyên Thứ trưởng Quốc phòng làm Chủ tịch VAVA; Phó Chủ tịch kiêm Tổng Thư ký, Giáo sư Trần Xuân Thu; các Phó Chủ tịch: Giáo sư Nguyễn Trọng Nhân, và Giáo sư Nguyễn Thị Ngọc Phượng.
Tại Ðại hội, VAVA cũng tiến hành tổng kết phong trào thi đua của hội, trao phần thưởng tặng một số tập thể, cá nhân tiêu biểu.