Mục tiêu của đề án là tạo điều kiện thuận lợi cho người nghèo, người dân ở vùng nông thôn, vùng núi, vùng sâu, vùng xa có điều kiện tiếp cận các dịch vụ y tế có chất lượng cao; đồng thời giảm tình trạng quá tải của các bệnh viện tuyến cuối và nâng cao chất lượng đội ngũ cán bộ y tế.
Tổng số vốn đầu tư (từ nguồn phát hành trái phiếu Chính phủ, ngân sách hằng năm của địa phương và từ nguồn vốn ODA) để thực hiện đề án vào khoảng 45.280 tỷ đồng. Theo đó, tổng số bệnh viện được đầu tư xây dựng, cải tạo, nâng cấp về cơ sở hạ tầng, trang thiết bị gồm: 78 bệnh viện đa khoa tỉnh và trung ương; 55 bệnh viện lao; 40 bệnh viện, trung tâm tâm thần; 33 bệnh viện nhi, sản nhi và 9 bệnh viện, trung tâm ung bướu; bảy khoa ung bướu của các bệnh viện đa khoa thuộc Bộ Y tế, bệnh viện đa khoa các tỉnh, thành phố; viện các bệnh Truyền nhiễm và Nhiệt đới quốc gia và Trường đại học Y dược Cần Thơ.
