Sau khi nghị án, hội đồng xét xử (HĐXX) đã tuyên án đối với các bị cáo trong vụ án. Theo đó, tại phiên phúc thẩm, các bị cáo được HĐXX tuyên giảm án, gồm: Văn Hữu Chiến (cựu Chủ tịch UBND TP Đà Nẵng) chịu mức án 10 năm tù (án sơ thẩm 12 năm tù) về tội vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí và tội vi phạm các quy định về quản lý đất đai; Nguyễn Ngọc Tuấn (cựu Phó Chủ tịch UBND TP Đà Nẵng) chịu mức án 3 năm tù về tội vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí và tội vi phạm các quy định về quản lý đất đai (án sơ thẩm 5 năm tù).
Cùng về các tội danh nêu trên, bị cáo Nguyễn Đình Thống (nguyên Giám đốc Công ty quản lý và khai thác đất Đà Nẵng) chịu mức án 18 tháng tù (án sơ thẩm 2 năm tù); Trần Phi (nguyên Tổng giám đốc Công ty xuất nhập khẩu Đà Nẵng) chịu mức án 12 tháng tù (án sơ thẩm 2 năm tù); Lê Anh Tuấn (nguyên Chủ tịch HĐQT kiêm Giám đốc Công ty CP Cung ứng tàu biển Đà Nẵng) chịu mức án 18 tháng tù treo (án sơ thẩm 18 tháng tù giam); Huỳnh Tấn Lộc (nguyên Giám đốc Công ty Công nghệ phẩm Đà Nẵng) chịu mức án 18 tháng tù treo (án sơ thẩm 18 tháng tù giam); Đào Tấn Bằng (nguyên Phó Chánh Văn phòng UBND TP Đà Nẵng) chịu mức án 18 tháng tù treo (án sơ thẩm 18 tháng tù giam).
HĐXX tuyên y án sơ thẩm đối với Trần Văn Minh (17 năm tù) và Phan Văn Anh Vũ (25 năm tù), cùng về tội vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí và tội vi phạm các quy định về quản lý đất đai. Đối với bị cáo Phan Văn Anh Vũ, tổng hợp hình phạt với các bản án đã tuyên trước đó, bị cáo phải chịu mức án 30 năm tù. Ngoài hai bị cáo trên, 11 bị cáo khác trong vụ án cũng bị HĐXX tuyên y án sơ thẩm.
Tại phiên toà, HĐXX nêu rõ, bản án cấp sơ thẩm kết luận cựu Chủ tịch UBND TP Đà Nẵng Trần Văn Minh phạm tội vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí và tội vi phạm các quy định về quản lý đất đai là đúng người, đúng tội.
Đối với bị cáo Phan Văn Anh Vũ, HĐXX cho rằng, có đủ căn cứ xác định bị cáo Vũ cùng bị cáo Minh và các bị cáo khác có sự thống nhất về hành vi trái pháp luật. Doanh nghiệp không thuộc diện được mua nhà. đất công sản nhưng Vũ đã lợi dụng các mối quan hệ với bị cáo Minh, nhờ các công ty nhà nước đứng tên giúp. Sau khi thâu tóm, bằng nhiều cách, bị cáo Vũ đã chuyển nhượng trái pháp luật các tài sản này. Hành vi của Vũ được sự tiếp tay của cựu lãnh đạo TP Đà Nẵng đã tạo nên sự bất bình đẳng giữa các doanh nghiệp trong thời gian dài. Mức án sơ thẩm đã tuyên với bị cáo Vũ là "không oan, không nặng" nên cấp phúc thẩm không có cơ sở chấp nhận kháng cáo.