Đây là nguồn vốn ngân sách thuộc kế hoạch vốn đầu tư công trung hạn giai đoạn 2021-2025; trong đó dự kiến, năm 2022 bố trí 200 tỷ đồng, năm 2023 bố trí 861,5 tỷ đồng.
Trong quá trình thực hiện, trường hợp có phát sinh làm tăng tổng mức đầu tư của dự án, Ủy ban nhân dân thành phố sẽ trình xin ý kiến Hội đồng nhân dân thành phố về việc bố trí vốn ngân sách địa phương để tham gia thực hiện theo yêu cầu của Chính phủ.
Dự án cao tốc Châu Đốc-Cần Thơ-Sóc Trăng đoạn qua địa bàn thành phố Cần Thơ có chiều dài 37,2km, với tổng mức đầu tư hơn 9.800 tỷ đồng; trong đó, kinh phí bồi thường, hỗ trợ, tái định cư là hơn 2.132 tỷ đồng.