Theo quyết định của Bộ Y tế có bảy tổ công tác sẽ hỗ trợ tăng cường cho bảy tỉnh khu vực miền trung gồm: Hà Tĩnh, Quảng Bình, Quảng Trị, Thừa Thiên Huế, Quảng Nam, Quảng Ngãi và Bình Định. Thành phần tham gia hỗ trợ, tăng cường đến các tỉnh đều là các chuyên gia đến từ các cục/vụ và viện đầu ngành của Bộ Y tế.
Tổ 1 hỗ trợ, tăng cường cho tỉnh Hà Tĩnh do lãnh đạo Cục Y tế dự phòng đảm nhiệm vai trò Tổ trưởng; Phó tổ trưởng do lãnh đạo Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Côn trùng Trung ương đảm nhiệm
Thành viên gồm cán bộ của các cục, viện: Cục Y tế dự phòng, Cục Quản lý môi trường y tế, Cục An toàn thực phẩm, Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Côn trùng Trung ương, Viện Dinh dưỡng.
Tổ 2 hỗ trợ, tăng cường cho tỉnh Quảng Bình: Tổ trưởng do lãnh đạo Cục Quản lý môi trường y tế đảm nhiệm; Phó Tổ trưởng do lãnh đạo Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương đảm nhiệm,
Thành viên gồm cán bộ của các cục, viện: Cục Y tế dự phòng, Cục Quản lý môi trường y tế, Cục An toàn thực phẩm, Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương, Viện Dinh dưỡng.
Tổ 3 hỗ trợ, tăng cường cho tỉnh Quảng Trị: Tổ trưởng do lãnh đạo Cục An toàn thực phẩm đảm nhiệm; Phó Tổ trưởng do lãnh đạo Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Côn trùng Quy Nhơn đảm nhiệm.
Thành viên gồm cán bộ của các cục, viện: Cục Y tế dự phòng, Cục Quản lý môi trường y tế, Cục An toàn thực phẩm, Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Côn trùng Quy Nhơn, Viện Dinh dưỡng.
Tổ 4 hỗ trợ, tăng cường cho tỉnh Thừa Thiên Huế: Tổ trưởng do lãnh đạo Cục Quản lý môi trường y tế đảm nhiệm; Phó Tổ trưởng do lãnh đạo Viện Sức khỏe nghề nghiệp và môi trường đảm nhiệm,
Thành viên gồm cán bộ của các cục, viện: Cục Y tế dự phòng, Cục Quản lý môi trường y tế, Cục An toàn thực phẩm, Viện Sức khỏe nghề nghiệp và môi trường, Viện Dinh dưỡng.
Tổ 5 hỗ trợ, tăng cường cho tỉnh Quảng Nam: Tổ trưởng do lãnh đạo Cục Y tế dự phòng đảm nhiệm; Phó tổ trưởng do lãnh đạo Viện Pasteur Nha Trang đảm nhiệm.
Thành viên gồm cán bộ của các cục, viện: Cục Y tế dự phòng, Cục Quản lý môi trường y tế, Cục An toàn thực phẩm, Viện Pasteur Nha Trang, Viện Dinh dưỡng.
Tổ 6 hỗ trợ, tăng cường cho tỉnh Quảng Ngãi: Tổ trưởng do lãnh đạo Cục An toàn thực phẩm đảm nhiệm; Phó tổ trưởng do lãnh đạo Viện Sức khỏe nghề nghiệp và môi trường đảm nhiệm,
Thành viên gồm cán bộ của các cục, viện: Cục Y tế dự phòng, Cục Quản lý môi trường y tế, Cục An toàn thực phẩm, Viện Sức khỏe nghề nghiệp và môi trường, Viện Dinh dưỡng.
Tổ 7, hỗ trợ, tăng cường cho tỉnh Bình Định: Tổ trưởng do lãnh đạo Cục Phòng chống HIV/AIDS đảm nhiệm, Phó tổ trưởng do lãnh đạo Viện Pasteur Nha Trang đảm nhiệm,
Thành viên gồm cán bộ của các cục, viện: Cục Phòng chống HIV/AIDS, Cục Quản lý môi trường y tế, Cục An toàn thực phẩm, Viện Pasteur Nha Trang, Viện Dinh dưỡng.
Theo quyết định của Bộ Y tế, các tổ này có nhiệm vụ đánh giá nguy cơ, tình hình dịch bệnh và khả năng đáp ứng của y tế địa phương.
Kiểm tra, giám sát, hỗ trợ cán bộ y tế và người dân thực hiện các biện pháp xử lý môi trường; phòng, chống những dịch bệnh phổ biến trong mùa mưa lũ; thu gom, xử lý xác súc vật chết, tổ chức phun hóa chất diệt côn trùng và véctơ gây bệnh tại khu vực bị ngập sau khi nước rút, xử lý các giếng khoan, giếng đào theo hướng dẫn của Bộ Y tế, triển khai thau rửa và khử trùng bể chứa, dụng cụ chứa nước ăn uống, sinh hoạt bằng chế phẩm khử khuẩn đã được Bộ Y tế cấp giấy chứng nhận đăng ký lưu hành còn hiệu lực.
Hỗ trợ, tư vấn dinh dưỡng cho người dân, đặc biệt là các đối tượng yếu thế như phụ nữ mang thai, trẻ nhỏ, người già,…
Hỗ trợ, hướng dẫn ngành y tế các tỉnh tổ chức các đoàn công tác kiểm tra, theo dõi tình hình vệ sinh môi trường, tăng cường giám sát chất lượng nước sạch sử dụng cho mục đích sinh hoạt của người dân, giám sát chặt chẽ công tác quản lý chất thải trong các cơ sở y tế trên địa bàn.
Quyền Bộ trưởng Nguyễn Thanh Long yêu cầu sau năm ngày, các tổ phải có mặt tại các tỉnh để triển khai thực hiện nhiệm vụ.
Về phía Sở Y tế các địa phương nêu trên, Bộ Y tế đề nghị Sở Y tế có trách nhiệm chủ trì, phối hợp với các tổ trưởng tổ công tác xây dựng kế hoạch hỗ trợ cho tuyến y tế cơ sở khắc phục hậu quả thiên tai, phòng chống dịch bệnh và giải quyết các nguy cơ về y tế; cung cấp hóa chất, vật tư cho các tổ công tác triển khai nhiệm vụ theo đề xuất của tổ trưởng, nếu thiếu đề nghị Sở Y tế báo cáo Bộ Y tế bổ sung.