Mục tiêu của Đề án nhằm nâng cao năng lực quản lý cho các cán bộ ngành huyện, vườn quốc gia và các xã vùng đệm trong việc kiểm soát, ngăn ngừa sinh vật ngoại lai xâm hại ở vườn quốc gia Tràm Chim; hạn chế sự xâm lấn của các loài sinh vật ngoại lai xâm hại vào bên trong vườn quốc gia nhằm bảo tồn đa dạng sinh học vùng đất ngập nước.
Tổng kinh phí thực hiện Đề án hơn bốn tỷ đồng, từ nguồn kinh phí sự nghiệp môi trường bố trí cho vườn quốc gia hằng năm.