Theo đề án thành lập, Trường đại học Y Dược phát triển theo định hướng nghiên cứu tiên tiến trong lĩnh vực y tế của khu vực, đào tạo và cung cấp nguồn nhân lực, sản phẩm khoa học chăm sóc sức khỏe ở trình độ cao, chuyển giao công nghệ đáp ứng yêu cầu phát triển kinh tế - xã hội của đất nước và từng bước tiếp cận tiêu chuẩn quốc tế; góp phần nâng cao năng lực cạnh tranh của y dược học Việt Nam; chủ động hội nhập quốc tế trong lĩnh vực khoa học sức khỏe.
Trường Đại học Y Dược sẽ tập trung phát triển các lĩnh vực có nhu cầu cao của ngành khoa học sức khỏe: Y học (bệnh học, điều trị học), dược học (nghiên cứu và phát triển thuốc), công nghệ và kỹ thuật y học hiện đại (công nghệ y sinh học phân tử - tế bào, kỹ thuật xét nghiệm, kỹ thuật hình ảnh y học, thiết bị và vật liệu y sinh…); kết hợp nghiên cứu và triển khai ứng dụng các sản phẩm khoa học liên ngành sẵn có ở Đại học Quốc gia (ĐHQG) Hà Nội như khoa học và công nghệ y - sinh phân tử - tế bào - miễn dịch, công nghệ nano, các phương pháp xét nghiệm, chẩn đoán, điều trị mới…
Hiện nay Trường đại học Y Dược có 147 cán bộ cơ hữu, trong đó có 52 cán bộ giảng dạy, bảo đảm tỷ lệ một cán bộ giảng dạy/15 sinh viên. Bên cạnh đó là đội ngũ giảng viên thỉnh giảng với trên 350 người là các chuyên gia đầu ngành trong các lĩnh vực y học, dược học.
Theo GS,TS, Thầy thuốc Nhân dân Lê Ngọc Thành, Chủ nhiệm Khoa Y Dược, nay là Trường đại học Y Dược, việc thành lập Trường Đại học Y Dược trên cơ sở nâng cấp Khoa Y Dược là phù hợp chủ trương của Đảng và Nhà nước, phù hợp với xu hướng các cơ sở giáo dục đại học tiên tiến trên thế giới, phù hợp với chủ trương xây dựng và hoàn thiện cơ cấu đa ngành, đa lĩnh vực của ĐHQG Hà Nội, góp phần phát triển và hoàn thiện hệ thống y tế quốc gia; đào tạo đội ngũ cán bộ khoa học y - dược, quản lý y tế chất lượng cao, góp phần vào sự nghiệp bảo vệ và chăm sóc khỏe nhân dân và góp phần tạo hiệu quả trong công cuộc xây dựng và phát triển ĐHQG Hà Nội nói riêng và phát triển kinh tế - xã hội nói chung.
Trường đại học Y Dược sau khi được thành lập sẽ đáp ứng mô hình đại học định hướng nghiên cứu, đa ngành, đa lĩnh vực, có tính tự chủ cao của ĐHQG Hà Nội.
Sự phát triển Trường Đại học Y Dược trong ĐHQG Hà Nội với bảy trường đại học thành viên, bốn khoa trực thuộc, bảy viện nghiên cứu, 11 trung tâm... cho phép phát triển các chương trình đào tạo mới có tính đa ngành như: Quản trị bệnh viện, Tin học chăm sóc sức khỏe, Vật lý Y khoa, Tâm lý học lâm sàng…
GS,TS Lê Ngọc Thành cho biết, khác với các trường đào tạo y dược khác, Trường đại học Y Dược là một tổ hợp đào tạo, nghiên cứu và dịch vụ sức khỏe hoàn chỉnh, được xây dựng và hoạt động trên cơ sở kết hợp khoa học và công nghệ y dược hiện đại với thế mạnh của khoa học cơ bản và công nghệ của các trường đại học thành viên trong ĐHQG Hà Nội, đáp ứng yêu cầu cấp thiết hiện nay về nhu cầu nguồn nhân lực có trình độ cao phục vụ cho sự nghiệp chăm sóc, bảo vệ và nâng cao sức khỏe nhân dân, góp phần vào sự nghiệp công nghiệp hóa, hiện đại hóa đất nước.
Trường Đại học Y Dược hoạt động theo cơ chế tự chủ của đơn vị sự nghiệp công lập do Chính phủ quy định, tới năm 2025 sẽ xây dựng và hoàn thiện mô hình tiên tiến về đào tạo một số ngành tại ĐHQG Hà Nội với quy mô tuyển sinh đại học mỗi năm khoảng 1.000 sinh viên. Quy mô đào tạo sau đại học/tổng quy mô đào tạo tăng dần và đạt 30%; tỷ lệ quy mô đào tạo tiến sĩ/quy mô sau đại học đạt 30%; sinh viên quốc tế chiếm 5%.
Hiện nay, Trường đại học Y Dược đã ký hợp đồng nguyên tắc đào tạo với 23 bệnh viện thực hành trên địa bàn Hà Nội, trong đó có 11 bệnh viện đã ký lại hợp đồng nguyên tắc đào tạo theo nghị định 111/2017/NĐ-CP ngày 5-10-2017 quy định về tổ chức đào tạo thực hành trong đào tạo khối ngành sức khỏe. Trong đó, Bệnh viện E là bệnh viện thực hành chính và Bệnh viện ĐHQG Hà Nội là bệnh viện trực thuộc chịu sự quản lý trực tiếp của khoa Y Dược.
Với định hướng gắn kết chặt chẽ giữa đào tạo và nghiên cứu, giữa lý thuyết và thực hành, Khoa Y Dược nay là Trường ĐH Y Dược hiện có 11 Bộ môn đặt văn phòng Bộ môn tại các bệnh viện tuyến trung ương là: Bộ môn Nội, Bệnh học, Ung thư và Y học hạt nhân tại bệnh viện Bạch Mai; Bộ môn Ngoại, Gây mê hồi sức ngoại khoa tại Bệnh viện Việt Đức; Bộ môn Nhi tại bệnh viện Nhi trung ương; Bộ môn Mắt tại Bệnh viện Mắt trung ương; Bộ môn Sản phụ khoa tại Bệnh viện Phụ sản Hà Nội; Bộ môn kỹ thuật Y học tại Bệnh viện E; Bộ môn Huyết học và Truyền máu tại Bệnh viện Huyết học và Truyền máu Trung ương, . . tạo điều kiện thuận lợi cho hoạt động đào tạo lâm sàng cho sinh viên của khoa.
Theo kế hoạch, Trường đại học Y Dược và Bệnh viện ĐHQG Hà Nội quy mô 1.000 giường sẽ được xây dựng mới tại Hòa Lạc với tổng diện tích 25ha.
