Trải qua 80 năm, các thế hệ cán bộ, nhân viên, chiến sĩ cơ yếu quân đội luôn khắc ghi lời dạy của Bác: “Mật mã phải bí mật, nhanh chóng, chính xác, các chú làm mật mã phải bí mật và đoàn kết”, đã bảo vệ tuyệt đối an toàn bí mật quốc gia, bí mật quân sự, không ngừng rèn luyện phẩm chất đạo đức, lối sống, đoàn kết nội bộ, hiệp đồng chặt chẽ với các cơ quan, đơn vị; xây dựng nền nếp chính quy, xây dựng các tổ chức Đảng vững mạnh về chính trị, tư tưởng, đạo đức, tổ chức và cán bộ; xây dựng cơ quan, đơn vị vững mạnh toàn diện “mẫu mực, tiêu biểu”.
Đến nay, ngành cơ yếu quân đội đã có đội ngũ cán bộ có khả năng nghiên cứu, làm chủ khoa học công nghệ hiện đại, tự lực, tự cường sản xuất các sản phẩm mật mã chuyên dụng, đáp ứng yêu cầu, nhiệm vụ của ngành cơ yếu trong giai đoạn mới.
Với những chiến công và thành tích xuất sắc trong công tác và chiến đấu, ngành cơ yếu quân đội có 7 tập thể và 1 cá nhân được Đảng, Nhà nước phong tặng danh hiệu Anh hùng lực lượng vũ trang nhân dân. Cục Cơ yếu, Bộ Tổng Tham mưu Quân đội nhân dân Việt Nam được Đảng, Nhà nước tặng thưởng 2 Huân chương Quân công (hạng Nhất và hạng Ba); Huân chương Chiến công hạng Nhì; Huân chương Bảo vệ Tổ quốc hạng Ba; 2 Giải thưởng Nhà nước về khoa học và công nghệ cùng nhiều phần thưởng cao quý khác.
Thừa ủy quyền của Chủ tịch nước, Đại tướng Nguyễn Tân Cương, Ủy viên Trung ương Đảng, Ủy viên Thường vụ Quân ủy Trung ương, Tổng Tham mưu trưởng Quân đội nhân dân Việt Nam, Thứ trưởng Quốc phòng đã trao Huân chương Bảo vệ Tổ quốc hạng Nhì tặng Cục Cơ yếu.
