Quyết định cải tổ được đưa ra sau khi ba quan chức cấp cao đồng loạt từ chức, gồm Bộ trưởng Phát triển nông thôn Kostas Tsiaras, Bộ trưởng Bảo vệ dân sự Ioannis Kefalogiannis và Thứ trưởng Y tế Dimitris Vartzopoulos. Theo Người phát ngôn Chính phủ Pavlos Marinakis, ngày 2/4, Văn phòng Công tố châu Âu (EPPO) đã yêu cầu Hy Lạp dỡ bỏ quyền miễn trừ nghị viện đối với 11 nghị sĩ bị nghi liên quan bê bối này, với cáo buộc chiếm đoạt hàng chục triệu euro từ quỹ trợ cấp nông nghiệp của Liên minh châu Âu (EU). Dù danh tính các nghị sĩ chưa được công bố chính thức, truyền thông địa phương cho biết, trong số này có các nhân vật cấp cao thuộc đảng cầm quyền Dân chủ Mới.
Vụ bê bối lần đầu được EPPO công bố vào tháng 5/2025. Khi đó, các công tố viên châu Âu cáo buộc tồn tại một “âm mưu gian lận có tổ chức”, trong đó các đối tượng đã khai báo sai sự thật, gian lận máy tính và lợi dụng chính sách để trục lợi. Theo điều tra của cơ quan chức năng, các nghi phạm đã khai báo quyền sở hữu đất không thuộc về mình, phóng đại số lượng vật nuôi, thậm chí nhận trợ cấp dù không hề hoạt động trong lĩnh vực nông nghiệp. Một số trường hợp gây sốc khi kê khai đồng cỏ trên khu khảo cổ, vườn cây ô-liu trong sân bay quân sự, hay thậm chí đồn điền chuối trên núi Olympus…
Dữ liệu từ OPEKEPE, đơn vị phụ trách quản lý trợ cấp nông nghiệp của EU tại Hy Lạp cho thấy, trong giai đoạn 2017-2020, khoảng 80% trợ cấp đồng cỏ được phân bổ về đảo Crete. Đáng chú ý, số lượng nông dân tại đây tăng thêm 13.000 người từ năm 2019 đến 2025, trong khi số lượng cừu và dê khai báo cũng tăng gấp đôi, trái ngược với xu hướng chung của cả nước.
Vụ bê bối này được cho là xuất phát từ những lỗ hổng quản lý sau khi Chính sách Nông nghiệp chung (CAP) của EU chuyển sang tính trợ cấp dựa trên diện tích đất thay vì số lượng vật nuôi từ năm 2014. Trong khi đó, hệ thống đăng ký đất đai tại Hy Lạp chưa hoàn thiện, khiến quyền sở hữu đất ở nhiều khu vực không rõ ràng. Điều này tạo điều kiện để các cá nhân lợi dụng, kê khai đất ở những nơi khác nhằm nhận tiền hỗ trợ.
Sau khi bê bối này bị đưa ra ánh sáng, tháng 6/2025, EU đã áp đặt mức phạt kỷ lục 392 triệu euro đối với Hy Lạp vì sai sót trong giám sát. Việc này dẫn đến tình trạng chậm thanh toán trợ cấp, châm ngòi cho các cuộc tuần hành phản đối chính phủ của nông dân trên toàn quốc. Tháng 10/2025, cảnh sát Hy Lạp đã bắt giữ 37 nghi phạm trong một chiến dịch quy mô lớn nhằm triệt phá mạng lưới gian lận. Các công tố viên cho biết, để che giấu dòng tiền bất hợp pháp, các đối tượng đã lập hóa đơn giả, chuyển tiền qua nhiều tài khoản ngân hàng và trộn lẫn với nguồn thu hợp pháp. Những bằng chứng quan trọng của cuộc điều tra bao gồm các đoạn ghi âm điện thoại, trong đó một số chính trị gia bị cáo buộc tìm cách bảo đảm trợ cấp cho cử tri ủng hộ mình.
Bê bối trợ cấp nông nghiệp này khiến Chính phủ Hy Lạp hứng chịu sự chỉ trích nặng nề từ dư luận. Nhiều nghị sĩ đối lập cũng như người dân yêu cầu chính phủ đương nhiệm phải giải trình trách nhiệm rõ ràng. Trước tình hình đó, Thủ tướng Kyriakos Mitsotakis khẳng định, các hành vi gian lận đã bắt đầu trước khi ông lên nắm quyền năm 2019, đồng thời cam kết sẽ đưa những kẻ vi phạm ra trước pháp luật và thu hồi toàn bộ số tiền bị chiếm đoạt. Dù vậy, giới phân tích cho rằng quá trình xử lý vụ án này vô cùng phức tạp do cơ chế pháp lý tại Hy Lạp quy định các bộ trưởng không thể bị truy tố độc lập, mà mọi thủ tục điều tra phải thông qua Quốc hội. Quy trình này thường kéo dài và dễ bị cản trở bởi đa số nghị sĩ của đảng cầm quyền, làm dấy lên lo ngại về khả năng truy cứu trách nhiệm đến cùng.
Theo Euronews, bê bối trợ cấp nông nghiệp nói trên được cho là "phép thử" đối với hệ thống quản trị và tính minh bạch của Hy Lạp. Kết quả điều tra sẽ ảnh hưởng trực tiếp đến niềm tin của người dân và quan hệ giữa nước này với EU trong việc quản lý và sử dụng các nguồn quỹ chung.